File Info

Filename
1029_0I_segments.tsv
Full Path
s3://ai-pipelines-experiment/chnobles/nf_soma_cnv_final_inline/results/blood_only/segments/1029_0I_segments.tsv
Size
21.6 KB
Published
Jun 02, 2026 5:22 PM
seg_id specimen_id chrom start end tumor_sample_id normal_sample_id n_probes n_het_sites cnlr_median cnlr_wmean mean_mbaf median_het_depth mean_valor mafR tcn lcn call clone_subset clone_purity purity clonal_frac n_clones dipLogR z_score residual_lr residual_lor germline_fit sample_type flowcell sample_id
1 1029_0I chr1 69641 26696238 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 7449 1216 0.0549 0.0467 0.5434 171.5 0.1709 0.0414 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 31.16 0.0549 0.1131 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
2 1029_0I chr1 26696238 26780803 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 248 0 0.2646 0.2065 5 0 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 22.64 -0.0002 0.0 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
3 1029_0I chr1 26780803 27363059 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 212 6 0.0703 0.0663 0.535 219.0 0.139 0.0129 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.64 0.0703 0.0863 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
4 1029_0I chr1 27363422 247896526 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 34306 4190 0.0437 0.0331 0.5427 142.0 0.1686 0.0359 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 53.26 0.0437 0.1043 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
5 1029_0I chr1 247921024 248441386 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 136 68 0.1375 0.1284 0.5684 599.3 0.2702 0.0808 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 12.46 0.1375 0.2427 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
6 1029_0I chr1 248441659 248918363 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 140 7 -0.0024 -0.0649 0.5964 681.0 0.385 0.1595 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 4.24 -0.0024 0.3599 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
7 1029_0I chr10 47057 133626762 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 16772 2310 0.0405 0.0316 0.5407 137.0 0.1602 0.0376 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 35.0 0.0405 0.095 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
8 1029_0I chr11 193064 1016583 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 670 132 0.0243 0.0178 0.5342 178.0 0.1355 0.0149 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.22 0.0243 0.0772 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
9 1029_0I chr11 1016632 1018432 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 9 33 -0.2102 -0.2864 0.631 857.5 0.5302 0.2902 1 0 del 1 0.4018 1.0 0.4018 1 -0.04 13.46 0.1134 -0.0046 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
10 1029_0I chr11 1018482 1242705 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 330 63 -0.0076 -0.0215 0.5456 195.0 0.1798 0.0387 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 4.51 -0.0076 0.1258 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
11 1029_0I chr11 1242787 1246677 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 19 34 0.463 0.4185 0.5877 1191.0 0.3497 0.1272 6 2 amp 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 13.94 -0.0268 0.0414 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
12 1029_0I chr11 1246747 1250740 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 21 23 0.0421 0.0309 0.6144 1166.5 0.4601 0.224 2 0 cn-loh 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 9.5 0.0421 0.0325 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
13 1029_0I chr11 1250814 1621888 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 118 57 0.0082 0.0085 0.5645 187.0 0.2554 0.0775 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 6.77 0.0082 0.2011 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
14 1029_0I chr11 1621964 1630356 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 5 6 0.0771 0.1787 0.6129 1514.0 0.4532 0.2937 3 0 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 4.88 -0.0167 0.0568 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
15 1029_0I chr11 1630434 134387716 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 21971 2770 0.0382 0.0286 0.5463 156.0 0.183 0.0413 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 41.97 0.0382 0.1219 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
16 1029_0I chr12 66830 133234376 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 25022 2870 0.0318 0.0275 0.5362 131.0 0.1425 0.0285 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 32.71 0.0318 0.0753 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
17 1029_0I chr13 19173833 101726867 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 6788 736 0.0312 0.0206 0.5377 115.0 0.1488 0.027 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 16.76 0.0312 0.0767 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
18 1029_0I chr13 101868717 114326203 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 1408 220 -0.0121 -0.0212 0.5397 128.0 0.1562 0.0333 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 6.35 -0.0121 0.0886 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
19 1029_0I chr14 18601119 105589813 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 12332 1526 -0.003 -0.0112 0.538 139.3 0.1502 0.0276 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 14.84 -0.003 0.0847 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
20 1029_0I chr14 105602323 105604986 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 18 0 0.2486 0.2229 3 0 amp 1 0.4018 1.0 0.4018 1 -0.04 5.73 -0.0155 0.0 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
21 1029_0I chr14 105626098 105644938 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 18 6 -0.0742 0.0023 0.6219 2475.3 0.4943 0.2307 2 0 cn-loh 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 5.52 -0.0742 0.0716 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
22 1029_0I chr14 105645213 105771388 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 158 49 -0.0308 -0.0357 0.5458 2222.0 0.1803 0.0264 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.61 -0.0308 0.1668 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
23 1029_0I chr14 105771337 105773026 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 10 19 0.095 0.1048 0.6016 3663.5 0.4049 0.1923 3 0 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 7.91 0.0012 0.0167 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
24 1029_0I chr14 105772990 105856969 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 59 6 0.0526 0.0453 0.5099 3446.0 0.0396 0.0009 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 2.21 0.0526 0.026 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
25 1029_0I chr14 105857353 105860445 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 33 0 -0.2137 -0.2284 0 0 del 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 6.67 -0.0056 0.0 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
26 1029_0I chr14 105860385 105863445 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 48 0 0.3001 0.2546 3 0 amp 1 0.464 1.0 0.464 1 -0.04 11.3 -0.0009 0.0 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
27 1029_0I chr14 105863385 106235271 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 122 28 0.063 0.0426 0.5372 752.0 0.148 0.0265 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 4.72 0.063 0.12 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
28 1029_0I chr14 106268658 106269461 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 9 4 0.2254 0.243 0.6545 1941.0 0.6378 0.4084 5 0 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 6.64 -0.0394 0.0465 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
29 1029_0I chr14 106269401 106874851 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 138 36 0.1481 0.0991 0.5917 696.0 0.3644 0.1052 3 0 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 13.12 0.0543 -0.0415 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
30 1029_0I chr15 20535569 58771523 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 7115 736 0.0255 0.0133 0.5427 136.0 0.1677 0.042 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 17.05 0.0255 0.1028 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
31 1029_0I chr15 58771764 86262924 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 5100 560 -0.0104 -0.0184 0.5417 108.0 0.1645 0.0297 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 10.34 -0.0104 0.0904 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
32 1029_0I chr15 86264206 101819015 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 3862 508 0.0348 0.0208 0.5201 219.0 0.0796 0.0112 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 12.05 0.0348 0.0265 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
33 1029_0I chr16 47432 2599640 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 2149 390 -0.0102 -0.0107 0.5425 167.0 0.1667 0.048 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 9.89 -0.0102 0.1087 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
34 1029_0I chr16 2599640 2600000 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 3 1 -0.1007 -0.0186 0.6938 5039.0 0.8177 2 0 cn-loh 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 0.95 -0.1007 0.0 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
35 1029_0I chr16 2600000 2602400 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 20 1 -0.014 -0.0099 0.5367 3158.0 0.1471 2 0 cn-loh 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 0.34 -0.014 0.0 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
36 1029_0I chr16 2602400 3579188 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 471 65 -0.0754 -0.0865 0.544 152.0 0.1739 0.025 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 9.75 -0.0754 0.1117 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
37 1029_0I chr16 3582286 3851063 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 479 12 0.1976 0.162 0.5105 1133.0 0.0418 0.0014 4 2 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 23.5 0.0158 0.0183 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
38 1029_0I chr16 3862047 23618920 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 3409 591 0.0274 0.013 0.5333 132.0 0.1319 0.0218 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 11.11 0.0274 0.064 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
39 1029_0I chr16 23621299 27359043 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 506 47 0.0801 0.0856 0.5415 147.8 0.1636 0.0421 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 10.26 0.0801 0.1008 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
40 1029_0I chr16 27360696 27364355 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 71 2 0.387 0.3478 0.5001 4383.0 0.0005 0.0 3 0 amp 1 0.6166 1.0 0.6166 1 -0.04 17.72 -0.0007 0.0 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
41 1029_0I chr16 27364355 90075935 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 9965 1387 0.0547 0.0464 0.5361 165.0 0.1423 0.0305 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 32.67 0.0547 0.0825 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
42 1029_0I chr17 137555 83094575 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 24120 3064 0.0504 0.041 0.543 169.0 0.1691 0.0439 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 50.57 0.0504 0.1111 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
43 1029_0I chr18 47389 80247372 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 7001 995 0.0206 0.0107 0.5411 124.0 0.1626 0.0313 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 16.08 0.0206 0.0931 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
44 1029_0I chr19 110681 58571441 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 23021 3415 0.0074 0.0025 0.5417 157.0 0.1643 0.0388 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 27.61 0.0074 0.1035 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
45 1029_0I chr2 41522 241873273 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 33700 3967 0.0445 0.0349 0.5375 148.0 0.1478 0.0343 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 50.34 0.0445 0.0847 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
46 1029_0I chr20 87677 5986131 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 1305 326 0.0052 -0.0075 0.5445 124.0 0.1755 0.0309 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 8.64 0.0052 0.1068 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
47 1029_0I chr20 5987229 64273595 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 8942 1210 0.0549 0.0469 0.537 151.0 0.1465 0.0233 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 31.02 0.0549 0.0833 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
48 1029_0I chr21 5117108 46664423 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 4602 866 0.0499 0.0416 0.5413 146.0 0.1631 0.0384 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 22.55 0.0499 0.0995 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
49 1029_0I chr22 15528158 15698809 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 9 4 -0.2549 -0.2387 0.6434 448.0 0.5876 0.3454 1 0 del 1 0.4018 1.0 0.4018 1 -0.04 6.44 0.0687 0.0386 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
50 1029_0I chr22 15707962 21975744 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 1540 246 0.0595 0.0517 0.5311 151.0 0.1223 0.0231 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 13.35 0.0595 0.0596 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
51 1029_0I chr22 22026064 22856343 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 288 49 0.1785 0.1099 0.5453 1229.1 0.1794 0.034 3 1 amp 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 17.19 0.0396 -0.0252 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
52 1029_0I chr22 22856367 22899679 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 186 29 0.2892 0.2382 0.5316 2221.0 0.1258 0.0172 5 2 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 21.59 0.0244 -0.0023 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
53 1029_0I chr22 22900387 22900610 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 3 1 -0.0367 -0.0512 0.69 4255.0 0.8 2 0 cn-loh 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 0.35 -0.0367 0.0 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
54 1029_0I chr22 22910482 23316015 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 431 67 0.0444 0.0289 0.5199 2949.5 0.0786 0.0078 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.54 0.0444 0.065 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
55 1029_0I chr22 23316015 23317575 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 9 5 0.0499 -0.0461 0.6277 3039.0 0.5168 0.3146 3 0 amp 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 5.12 -0.089 -0.0575 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
56 1029_0I chr22 23573267 50782316 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 6904 1038 0.0569 0.0464 0.5362 166.0 0.1429 0.0259 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 28.32 0.0569 0.0831 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
57 1029_0I chr3 319726 198169878 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 26937 3027 0.0447 0.0343 0.5413 142.0 0.1629 0.0347 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 46.61 0.0447 0.0986 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
58 1029_0I chr4 53399 190174838 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 17767 2316 0.054 0.0425 0.5428 128.8 0.1686 0.0349 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 44.73 0.054 0.1013 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
59 1029_0I chr5 113220 481662 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 209 128 0.0032 -0.0123 0.5385 213.0 0.1534 0.0262 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.02 0.0032 0.0996 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
60 1029_0I chr5 482528 181260807 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 19716 2408 0.0442 0.0335 0.5387 135.8 0.1527 0.0292 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 38.67 0.0442 0.0866 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
61 1029_0I chr6 304553 26020525 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 2374 398 0.0399 0.0337 0.5393 132.8 0.1551 0.0331 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 13.15 0.0399 0.0883 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
62 1029_0I chr6 26020489 26365404 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 262 35 0.1841 0.1716 0.524 388.5 0.0951 0.0162 4 2 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 16.26 0.0023 0.0556 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
63 1029_0I chr6 26368188 29727330 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 780 58 0.0127 -0.0108 0.5263 302.0 0.1043 0.0122 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 2.79 0.0127 0.0594 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
64 1029_0I chr6 29727934 29942342 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 54 71 -0.0033 0.0023 0.5378 1953.5 0.1511 0.0248 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.01 -0.0033 0.1334 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
65 1029_0I chr6 29942282 29945154 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 24 35 -0.0202 -0.0693 0.5886 660.4 0.3506 0.1178 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 8.63 -0.0202 0.3271 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
66 1029_0I chr6 29945084 29945564 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 12 20 -0.3498 -0.3991 0.6372 741.5 0.5616 0.3158 1 0 del 1 0.4018 1.0 0.4018 1 -0.04 12.5 -0.0262 0.0201 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
67 1029_0I chr6 29945504 29948387 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 18 40 -0.03 -0.1574 0.5414 3049.0 0.165 0.0322 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 4.32 -0.03 0.1515 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
68 1029_0I chr6 29948387 29949587 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 10 29 0.0094 -0.0091 0.6386 3359.6 0.5657 0.3396 2 0 cn-loh 1 0.3058 1.0 0.3058 1 -0.04 13.32 0.0094 -0.0762 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
69 1029_0I chr6 29950648 30987125 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 573 53 0.0074 -0.0022 0.5217 168.5 0.0859 0.0073 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 1.27 0.0074 0.0254 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
70 1029_0I chr6 30987199 31170618 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 111 57 0.0562 -0.0007 0.5432 290.5 0.1705 0.0337 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.33 0.0562 0.1264 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
71 1029_0I chr6 31264705 31357708 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 61 84 0.1207 0.1162 0.5877 468.2 0.3515 0.1245 3 0 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 13.93 0.0269 -0.0646 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
72 1029_0I chr6 31362126 32366206 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 1239 202 0.0253 0.0102 0.5253 263.0 0.1001 0.015 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.85 0.0253 0.0521 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
73 1029_0I chr6 32366146 32445089 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 44 64 0.0556 0.0601 0.5472 316.0 0.1872 0.048 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 5.52 0.0556 0.1445 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
74 1029_0I chr6 32521860 32522039 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 3 9 -0.0168 -0.0161 0.6756 2475.0 0.7312 0.5628 2 0 cn-loh 1 0.3058 1.0 0.3058 1 -0.04 9.58 -0.0168 0.0859 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
75 1029_0I chr6 32521980 32662239 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 41 85 0.1651 0.1268 0.5666 2062.3 0.2638 0.0531 4 1 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 11.77 -0.0167 0.0125 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
76 1029_0I chr6 32664797 32666712 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 7 38 -0.0659 -0.0105 0.6302 1715.0 0.5297 0.2821 2 0 cn-loh 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 14.13 -0.0659 0.1039 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
77 1029_0I chr6 32741338 33009643 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 277 101 0.0417 0.0139 0.5218 1388.0 0.0869 0.0118 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 4.78 0.0417 0.0658 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
78 1029_0I chr6 33064538 33068712 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 17 74 -0.0115 -0.015 0.6159 2634.8 0.4709 0.2227 2 0 cn-loh 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 17.49 -0.0115 0.0467 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
79 1029_0I chr6 33068684 33069340 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 8 19 0.2235 0.137 0.5403 1711.3 0.1608 0.0374 5 2 amp 1 0.1343 1.0 0.1343 1 -0.04 4.41 -0.0413 0.0303 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
80 1029_0I chr6 33069239 33087458 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 42 120 -0.0338 -0.0123 0.5952 1654.8 0.3832 0.1555 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 17.88 -0.0338 0.3659 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
81 1029_0I chr6 33087458 33087818 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 3 13 0.0771 -0.018 0.6375 3636.0 0.5613 0.321 3 0 amp 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 8.88 -0.0618 -0.0141 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
82 1029_0I chr6 33087818 33088778 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 8 11 -0.1003 -0.0821 0.5277 3639.5 0.1107 0.0147 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 2.11 -0.1003 0.0977 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
83 1029_0I chr6 33088778 33089258 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 3 9 -0.3476 -0.3298 0.604 3205.3 0.4135 0.2548 1 0 del 1 0.4018 1.0 0.4018 1 -0.04 6.36 -0.024 -0.1058 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
84 1029_0I chr6 33089258 33089738 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 4 9 -0.2792 -0.1722 0.5447 4112.0 0.1793 0.0325 1 0 del 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 3.76 -0.1255 -0.059 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
85 1029_0I chr6 33163609 134170946 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 12685 1524 0.0373 0.0262 0.5413 134.0 0.1632 0.0265 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 28.34 0.0373 0.0967 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
86 1029_0I chr6 134170981 170584636 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 5263 609 0.0597 0.0487 0.5279 163.3 0.1102 0.0198 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 24.15 0.0597 0.0493 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
87 1029_0I chr7 193154 152224647 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 20803 2580 0.0465 0.0352 0.5343 162.0 0.1355 0.0296 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 40.17 0.0465 0.0747 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
88 1029_0I chr7 152229878 152247194 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 32 11 0.1403 0.1105 0.5427 535.0 0.1668 0.031 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 4.76 0.1403 0.1367 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
89 1029_0I chr7 152247674 152248154 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 6 4 0.4037 0.417 0.6594 3050.0 0.6562 0.5848 3 1 amp 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 7.87 -0.1813 -0.047 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
90 1029_0I chr7 152249853 152273905 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 27 7 0.0612 0.1045 0.5928 1016.5 0.3699 0.1478 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 4.47 0.0612 0.3505 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
91 1029_0I chr7 152308049 159144810 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 621 101 0.0509 0.0416 0.5537 157.0 0.213 0.0476 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 9.68 0.0509 0.152 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
92 1029_0I chr8 166190 145054212 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 16663 2241 0.0477 0.0397 0.5314 152.0 0.124 0.0232 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 35.84 0.0477 0.061 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
93 1029_0I chr9 15056 17050 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 5 0 -0.6731 -0.8009 1 0 del 1 0.7447 1.0 0.7447 1 -0.04 8.18 -0.0012 0.0 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
94 1029_0I chr9 17350 136494616 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 17312 2088 0.0415 0.0283 0.5352 154.3 0.1386 0.0293 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 33.53 0.0415 0.0768 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
95 1029_0I chr9 136494518 136497616 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 80 4 0.4013 0.3939 0.5118 4439.0 0.0473 0.0021 4 2 amp 1 0.3058 1.0 0.3058 1 -0.04 19.51 0.0164 0.0352 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
96 1029_0I chr9 136498235 136524030 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 257 33 0.2467 0.1853 0.5165 1600.0 0.0658 0.0041 4 2 amp 1 0.2021 1.0 0.2021 1 -0.04 21.52 -0.0189 0.0461 False blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
97 1029_0I chr9 136529043 138231128 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 1068 111 0.0474 0.0455 0.536 175.0 0.1416 0.0307 2 1 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 9.29 0.0474 0.0839 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
98 1029_0I chrX 2853959 155545278 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 15570 0 -0.9505 -0.9652 1 0 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 644.44 0.0495 0.0 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
99 1029_0I chrY 2786997 20779689 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1 316 0 -0.9759 -0.983 1 0 neutral 1 1.0 1.0 1.0 1 -0.04 94.26 0.0241 0.0 True blood A23KCGYLT4 1029_0I-N1-BDNA-1_B23KGCJLT4_1
100 rows