File Info

Filename
869_DNH-T1-TDNA-1_B23KKT2LT4_1_vs_869_DNH-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/platform-users/chnobles/cgp_runs/cgp_dna_exp0024/tools_facets__dde85de3--20260304-153357/variant_calling/facets/869_DNH-T1-TDNA-1_B23KKT2LT4_1_vs_869_DNH-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1/869_DNH-T1-TDNA-1_B23KKT2LT4_1_vs_869_DNH-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Size
12.4 KB
Workflow Run
nobles_exp024_facets_update_02
Published
Mar 04, 2026 8:36 AM

Content

View in new tab
chrom seg num.mark nhet cnlr.median mafR segclust cnlr.median.clust mafR.clust start end cf.em tcn.em lcn.em
1 1 1 16458 1503 -0.116384484312837 0.00192667077201 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 925983 89011202 1 2 1
2 1 2 168 21 0.280697686656633 0.000122536695239809 20 0.254338557320468 0.000361906612811719 89011887 90007808 0.271162775350436 4 2
3 1 3 4096 335 -0.0740269746082254 0.00152386934910794 14 -0.0661693101589445 0.00208729193355268 90010155 121387870 1 2 1
4 1 4 8625 697 0.83214156702767 0.846620367611179 28 0.826162888737672 0.859787657546439 143796105 184702813 0.876154250830924 4 1
5 1 5 11 2 1.68121088122799 0.561016921571858 32 1.68121088122799 NA 184703081 184712650 0.876154250830924 8 NA
6 1 6 1312 105 0.814280854048621 0.899417187976426 28 0.826162888737672 0.859787657546439 184716846 200856184 0.876154250830924 4 1
7 1 7 2119 242 0.745943127755289 0.879863983621429 26 0.745943127755289 0.879863983621429 200857463 207359758 0.801887137295564 4 1
8 1 8 5242 477 0.815341701677968 0.872061464455926 28 0.826162888737672 0.859787657546439 207454465 247589352 0.876154250830924 4 1
9 1 9 211 51 1.12084180388606 0.776975670345912 31 1.12084180388606 0.776975670345912 247605506 248682334 0.876154250830924 4 1
10 1 10 53 0 0.827745347488579 0 29 0.826162888737672 NA 248739627 248918297 0.876154250830924 4 NA
11 2 11 1525 183 -0.119499691488869 -0.00470473894621024 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 41623 20260564 1 2 1
12 2 12 16 1 0.827602809742879 -0.160179624304964 29 0.826162888737672 NA 20263091 20308634 0.876154250830924 4 NA
13 2 13 13189 1136 -0.119902503383454 0.0020507447732921 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 20311448 131231012 1 2 1
14 2 14 2972 215 -0.0478303862530546 0.0103310608755169 15 -0.0661693101589445 0.0078992162083325 131236720 167243605 1 2 1
15 2 15 11 0 -0.973333016822718 0 2 -0.950618349836574 NA 167243931 167246300 0.853293751253392 1 0
16 2 16 2299 168 0.0119627383732027 0.00572018259362674 16 -0.0171834920190374 0.00215866496710637 167246682 178748325 1 2 1
17 2 17 15 0 -0.621263421469868 0 6 -0.646653073510731 NA 178748704 178753165 0.553651531891433 1 0
18 2 18 559 29 -0.027507805145444 0.00679320595620907 16 -0.0171834920190374 0.00215866496710637 178756183 185744325 1 2 1
19 2 19 94 24 -0.654694449488285 0.00604879036536673 5 -0.646653073510731 0.00604879036536673 185744528 185809178 0.311918771684597 0 0
20 2 20 3745 218 -0.0426205120353552 0.00102099186244191 14 -0.0661693101589445 0.00208729193355268 185813655 215945045 1 2 1
21 2 21 4752 437 -0.130390008277249 0.00178687627021156 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 215945542 241873382 1 2 1
22 3 22 5220 381 -0.104409689718108 -0.00100259701066451 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 319754 44242468 1 2 1
23 3 23 10 1 -0.92944456973598 -0.0230225282282143 2 -0.950618349836574 NA 44242827 44245307 0.853293751253392 1 0
24 3 24 6213 450 -0.0709227114850722 0.00869229684762335 13 -0.0661693101589445 0.00522192820670959 44254911 89399812 1 2 1
25 3 25 11 0 -0.645093047177476 0 6 -0.646653073510731 NA 89400265 89429263 0.553651531891433 1 0
26 3 26 11825 997 -0.0997523275519748 0.00389950454821296 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 89431145 198169834 1 2 1
27 4 27 2755 302 -0.152691331474614 -0.000802101854721579 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 53575 20850543 1 2 1
28 4 28 2908 278 -0.0864695030864716 -0.00457690784748548 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 20850744 65367540 1 2 1
29 4 29 17 0 0.677412741676597 0 25 0.677412741676597 NA 65377057 65602355 0.876154250830924 3 NA
30 4 30 4727 378 -0.0463391748080566 0.00316224323046995 14 -0.0661693101589445 0.00208729193355268 65643476 112612678 1 2 1
31 4 31 17 2 -0.978329299790632 -0.0231803572805494 2 -0.950618349836574 NA 112617427 112644623 0.853293751253392 1 0
32 4 32 5130 404 -0.0311190068096946 -0.000119454035026215 16 -0.0171834920190374 0.00215866496710637 112644631 190174880 1 2 1
33 5 33 11799 963 -0.0930133214279047 0.000689206408292666 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 92349 140705886 1 2 1
34 5 34 582 88 0.153215336120258 0.00412290210759709 18 0.167922059201473 0.0028574168418175 140786373 141487477 0.201938752000894 4 2
35 5 35 5090 429 -0.124579288638573 0.00100205588766075 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 141487650 181260765 1 2 1
36 6 36 2000 192 -0.0572200306780348 -0.00524745564715612 14 -0.0661693101589445 0.00208729193355268 292582 25855322 1 2 1
37 6 37 678 30 0.0904444703470145 -0.00695835929963205 17 0.0904444703470145 -0.00695835929963205 25861654 29588957 1 2 1
38 6 38 7111 596 -0.0786215644062949 0.00854009431469843 13 -0.0661693101589445 0.00522192820670959 29603467 70524032 1 2 1
39 6 39 13 2 -1.03683490624385 -0.021659642022726 1 -1.02455741216031 NA 70524277 70528548 0.876154250830924 1 0
40 6 40 2429 173 -0.0626588083321568 0.00449333798829031 14 -0.0661693101589445 0.00208729193355268 70533177 101686352 1 2 1
41 6 41 17 2 0.977478595303295 0.152485524750794 30 0.977478595303295 NA 101799811 102055566 0.614345853271978 6 NA
42 6 42 7353 691 -0.061184470118384 0.00136283909192622 13 -0.0661693101589445 0.00522192820670959 102063978 170584566 1 2 1
43 7 43 18600 1616 -0.106546501325103 0.00136473726941897 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 193097 159144893 1 2 1
44 8 44 3163 420 -0.0984794434824566 -0.000398047146632614 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 166190 30385231 1 2 1
45 8 45 504 60 -0.21711615176287 0.00215900956263905 9 -0.178570345883723 0.00215900956263905 30385280 32672784 1 2 1
46 8 46 10 1 -0.74741732970292 -0.00555749311878093 4 -0.74741732970292 NA 32673121 32675417 0.732605305412495 1 0
47 8 47 1245 143 -0.149742441355532 -3.29114135869465e-05 12 -0.111435798760442 -3.29114135869465e-05 32675797 39706996 1 2 1
48 8 48 2947 179 -0.0534514912122264 0.0057686349472297 15 -0.0661693101589445 0.0078992162083325 39723822 84804728 1 2 1
49 8 49 7 3 0.790616627830619 -0.0389350474126978 29 0.826162888737672 NA 84850069 84887811 0.876154250830924 4 NA
50 8 50 3502 288 -0.0691763792350846 0.00842934806881802 15 -0.0661693101589445 0.0078992162083325 84920799 127417070 1 2 1
51 8 51 1332 179 -0.16780294381018 0.00186936696000984 8 -0.178570345883723 0.000101116357015733 127730499 143536411 1 2 1
52 8 52 1051 119 -0.0150345812332105 0.002116247643306 16 -0.0171834920190374 0.00215866496710637 143538076 145054185 1 2 1
53 9 53 12762 1127 -0.0905577711031546 0.00023500550188131 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 14859 129830879 1 2 1
54 9 54 2463 238 -0.177871755506644 -0.000498215270616263 8 -0.178570345883723 0.000101116357015733 129831078 136799320 1 2 1
55 9 55 552 40 0.000252750918203627 0.00446639088124169 16 -0.0171834920190374 0.00215866496710637 136799809 137307014 1 2 1
56 9 56 340 33 -0.196693295757027 0.0127314505460865 10 -0.178570345883723 0.0127314505460865 137307151 138221150 1 2 1
57 10 57 15712 1426 -0.116262362305577 0.00254130785493154 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 47166 133626863 1 2 1
58 11 58 1725 262 -0.108521729682928 0.00494679363579381 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 193096 4390288 1 2 1
59 11 59 431 56 0.190996048946927 0.0025928964155756 18 0.167922059201473 0.0028574168418175 4390393 6224555 0.201938752000894 4 2
60 11 60 5143 398 -0.099855078985061 -5.23059318198824e-05 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 6239249 48160146 1 2 1
61 11 61 388 69 0.249998778237059 0.000404624792787442 20 0.254338557320468 0.000361906612811719 48163554 56989189 0.271162775350436 4 2
62 11 62 6309 442 -0.0932034523555593 -0.000709789372955012 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 56989472 76454928 1 2 1
63 11 63 10 2 0.74434158004497 0.0249271246562186 27 0.745943127755289 NA 76458161 76496495 0.699096690718888 4 NA
64 11 64 5708 369 -0.101155719933976 -0.00330923275148075 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 76513442 123729534 1 2 1
65 11 65 189 13 0.16053981359901 -0.000510890564607684 19 0.167922059201473 NA 123729759 124647525 NA 2 NA
66 11 66 1239 128 -0.113326974924569 0.00318775702362039 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 124648009 134387729 1 2 1
67 12 67 13976 1218 -0.0955464547211453 0.0022071228071322 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 66973 92140450 1 2 1
68 12 68 11 0 -0.950618349836574 0 2 -0.950618349836574 NA 92140856 92143438 0.853293751253392 1 0
69 12 69 7283 583 -0.13554266639125 0.00323766608680242 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 92143580 133234294 1 2 1
70 13 70 7125 562 -0.0940753949130048 2.09806269483627e-05 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 19173908 114326372 1 2 1
71 14 71 11359 856 -0.099227654058763 0.00184945850732422 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 18601234 105529810 1 2 1
72 15 72 11365 931 -0.118844836638716 0.00226782421406158 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 20535333 87927983 1 2 1
73 15 73 827 81 -0.242191050632476 0.000310717947429817 7 -0.251328729892615 0.000803796626358143 87928298 88262030 1 2 1
74 15 74 1679 187 -0.129453098731158 0.00217316013407076 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 88459763 101923088 1 2 1
75 16 75 2253 296 0.461747429198263 0.306801457347584 23 0.460157030473691 0.304914944879095 47354 3437190 0.876154250830924 3 1
76 16 76 4071 355 0.370231235386253 0.310320156495194 22 0.385265753768883 0.327521822541692 3437536 28593368 0.802128841502864 3 1
77 16 77 1440 60 0.457361111389407 0.280005430525234 23 0.460157030473691 0.304914944879095 28593599 32255035 0.876154250830924 3 1
78 16 78 7358 808 -0.898828064359449 2.46366043493428 3 -0.898828064359449 2.46366043493428 46581824 90075983 0.846160915079068 1 0
79 17 79 4120 436 -0.0910496539781046 3.30145636059189e-05 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 137668 10357892 1 2 1
80 17 80 265 11 0.25031449631053 -0.0192783976008812 21 0.254338557320468 NA 10360071 10642567 0.569523727939147 3 NA
81 17 81 6058 446 -0.119765194484096 -8.88311166132493e-05 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 10642775 40749443 1 2 1
82 17 82 294 49 0.167231255438683 4.70501589280028e-06 18 0.167922059201473 0.0028574168418175 40750356 41393976 0.201938752000894 4 2
83 17 83 11133 1062 -0.110185090656786 0.00160948206872413 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 41394216 83094678 1 2 1
84 18 84 6264 591 -0.0737882767604389 0.00426432363370209 14 -0.0661693101589445 0.00208729193355268 47547 80247357 1 2 1
85 19 85 1139 187 0.44862495330178 0.30245308259756 23 0.460157030473691 0.304914944879095 110705 2098989 0.876154250830924 3 1
86 19 86 13183 1473 0.384450073257167 0.33453899839714 22 0.385265753768883 0.327521822541692 2099251 43884065 0.802128841502864 3 1
87 19 87 224 18 0.581685036251673 0.377529191136817 24 0.581685036251673 0.377529191136817 43913423 44477537 0.638433959022974 4 1
88 19 88 5603 673 0.397707411084073 0.316674137234392 22 0.385265753768883 0.327521822541692 44477666 56539811 0.802128841502864 3 1
89 19 89 790 103 0.49248979367367 0.320184752545789 23 0.460157030473691 0.304914944879095 56547507 58571416 0.876154250830924 3 1
90 20 90 9290 818 -0.126264049767781 -0.00243247116208722 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 87734 64273701 1 2 1
91 21 91 113 18 -0.270093476935853 -0.0150685246815098 7 -0.251328729892615 0.000803796626358143 5117084 14224611 1 2 1
92 21 92 484 47 -0.035966857499771 -0.00329177342046639 16 -0.0171834920190374 0.00215866496710637 14226797 29054069 1 2 1
93 21 93 13 0 -1.00339860937987 0 1 -1.02455741216031 NA 29054298 29063615 0.876154250830924 1 0
94 21 94 1813 199 -0.0559242441587501 0.00620557056770737 15 -0.0661693101589445 0.0078992162083325 29064942 41503852 1 2 1
95 21 95 1557 219 -0.179868983685819 -0.000162082658766441 8 -0.178570345883723 0.000101116357015733 41504165 46664501 1 2 1
96 22 96 1409 182 -0.145187132894136 -0.000270286438376109 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 15528179 22887738 1 2 1
97 22 97 276 80 -0.285441385567698 0.00163725130211387 7 -0.251328729892615 0.000803796626358143 22888006 23693783 1 2 1
98 22 98 6334 733 -0.120381648047887 0.00172522317058266 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 23694009 50782220 1 2 1
99 23 99 5519 229 -0.12260562890524 0.00301881152798933 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 284226 55718380 1 2 1
100 23 100 20 0 -0.653243890462003 0 6 -0.646653073510731 NA 55719297 56250183 0.553651531891433 1 0
101 23 101 7799 367 -0.136306593516974 0.00455289979265984 11 -0.111435798760442 0.00125245406262825 56265207 155545304 1 2 1
102 rows