File Info

Filename
1029_YCN-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1029_YCN-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/platform-users/chnobles/cgp_runs/cgp_dna_exp0024/tools_facets__dde85de3--20260304-153357/variant_calling/facets/1029_YCN-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1029_YCN-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1/1029_YCN-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1029_YCN-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Size
15.7 KB
Workflow Run
nobles_exp024_facets_update_02
Published
Mar 04, 2026 8:38 AM

Content

View in new tab
chrom seg num.mark nhet cnlr.median mafR segclust cnlr.median.clust mafR.clust start end cf.em tcn.em lcn.em
1 1 1 3386 391 -0.0604972164801067 0.00236149553697306 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 69241 12775179 1 2 1
2 1 2 171 46 -0.794825708816931 0.0265295811940584 11 -0.807955860694217 0.0265295811940584 12775542 13420620 0.441998956951174 0 0
3 1 3 1214 129 -0.0376942704430706 0.005416102417854 37 -0.01937441742574 0.0030622593552714 13420881 18890182 1 2 1
4 1 4 4101 285 0.0303469561990037 -0.00026414824696255 40 0.0270270590336299 0.000681742243898265 18902596 34869073 1 2 1
5 1 5 12179 836 -0.0806646333088441 -0.000319717357909342 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 34885094 145748142 1 2 1
6 1 6 543 28 0.112461846056128 0.105939051647192 42 0.113851879079531 0.151371835821574 145750365 149704977 0.157759676063916 3 0
7 1 7 15851 1262 0.254159077066421 0.105007244833116 46 0.261987398842553 0.108796677837441 149782720 237667945 0.423673850999907 3 1
8 1 8 1258 142 0.0530302010656947 0.110022483370436 41 0.0270270590336299 0.110022483370436 237668065 248918358 0.393731290896606 3 1
9 2 9 3284 226 -0.0592753478181175 0.00123105960473416 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 41662 27653443 1 2 1
10 2 10 1914 163 0.218452075017899 0.0986936581456702 44 0.198411361913555 0.10343234674421 27653791 42330128 0.379568843481219 3 1
11 2 11 693 53 -0.0979635759036867 0.0036627563449249 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 42330687 47374118 1 2 1
12 2 12 212 25 -0.667251253617436 -0.00413380195599451 17 -0.658413000663963 -0.000478020045076792 47375102 47857227 0.309919738974303 0 0
13 2 13 761 85 -0.0774084031531617 -0.00747365087324132 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 47875264 55687814 1 2 1
14 2 14 2706 185 0.242893458358123 0.0968604996258501 46 0.261987398842553 0.108796677837441 55693764 84459339 0.423673850999907 3 1
15 2 15 1642 151 -0.0826617100439412 0.00814703340030552 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 84517846 97245416 1 2 1
16 2 16 8 2 -2.04733296371015 -0.3870556069064 1 -2.04733296371015 NA 97245729 97512134 0.441998956951174 0 0
17 2 17 2234 195 -0.119951757850849 0.00476291841456971 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 97513254 113216045 1 2 1
18 2 18 96 38 -0.739314244202507 0.00182160967817272 12 -0.735078137507158 0.00177037696685137 113216340 113242249 0.34955149308368 0 0
19 2 19 6230 494 -0.130500089132609 0.00799375312802889 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 113242555 178546800 1 2 1
20 2 20 601 18 -0.504334807814231 0.0168570363914593 22 -0.488404838907414 0.0168570363914593 178547113 178775140 0.253218975371549 0 0
21 2 21 5783 389 -0.0636147308346338 0.00236891535579709 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 178775571 221572295 1 2 1
22 2 22 77 1 -1.11438802700527 0.00253204397051723 7 -1.09176718811451 NA 222199981 222220031 0.441998956951174 0 0
23 2 23 3388 334 -0.0620548886592038 0.000169970376600419 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 222220147 241873341 1 2 1
24 3 24 1317 127 -0.0114954692575424 0.612264644707678 38 -0.01937441742574 0.636927515192182 319809 12190639 0.379170987365012 2 0
25 3 25 368 42 -0.788385789093159 0.569071872466835 10 -0.807955860694217 0.614438475439176 12287374 12503168 0.416004881266791 0 0
26 3 26 21934 1608 -0.0809832687590707 0.624838033212234 34 -0.0673093699507096 0.627062624673822 12503532 198169947 0.376642145518936 2 0
27 4 27 39 7 -0.0554472853835521 0.0796432384259693 36 -0.0673093699507096 NA 53505 443653 NA 2 NA
28 4 28 1963 203 0.240821683253759 0.117427830965231 47 0.261987398842553 0.12688410170896 443835 8950006 0.441998956951174 3 1
29 4 29 28 3 -1.98786643584933 0.0042566881006463 2 -1.98786643584933 NA 8950371 9269154 0.441998956951174 0 0
30 4 30 2119 171 0.163402483700994 0.0934598697958017 44 0.198411361913555 0.10343234674421 9444542 42398378 0.379568843481219 3 1
31 4 31 11618 908 -0.100702699324412 0.0030922661201714 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 42400975 190174779 1 2 1
32 5 32 17717 1424 0.457435503830416 0.000936950314163465 51 0.457435503830416 0.000936950314163465 92226 181260906 0.40790780400494 4 2
33 6 33 12572 1345 -0.0526159605121348 0.00748781594840084 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 292489 106248224 1 2 1
34 6 34 2066 155 -0.478611485860544 0.220947490433946 21 -0.488404838907414 0.223411649916315 106248360 126348618 0.441998956951174 1 0
35 6 35 116 3 -1.30881622229469 0.2018844344419 3 -1.30881622229469 NA 127119173 127155198 0.441998956951174 0 0
36 6 36 5097 513 -0.423038435822523 0.223878799441734 23 -0.412932665840492 0.226426875372337 127155412 170584697 0.441595200021458 1 0
37 7 37 98 11 0.0944661231778477 0.0215367273559261 43 0.113851879079531 NA 193189 851547 0.0992604696925046 4 NA
38 7 38 1711 175 -0.0589973839045691 0.000827936453457571 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 852072 12688201 1 2 1
39 7 39 348 83 -0.732320248382444 0.00179762650861968 12 -0.735078137507158 0.00177037696685137 12688610 13989667 0.34955149308368 0 0
40 7 40 3751 305 -0.0353314786280404 0.00319482646866722 39 -0.01937441742574 0.00655797826875317 13991088 54569240 1 2 1
41 7 41 205 19 -0.574003195510108 0.00889262885371511 19 -0.563690415757216 0.00574526261827675 54752493 55211767 0.308888526711076 0 0
42 7 42 7714 601 -0.116618002338531 0.00515052108715104 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 55216561 127374892 1 2 1
43 7 43 5037 485 0.20843204936678 0.101308791133865 44 0.198411361913555 0.10343234674421 127375066 159144665 0.379568843481219 3 1
44 8 44 3333 394 -0.0254494658283564 0.616685041571663 38 -0.01937441742574 0.636927515192182 166247 30833320 0.379170987365012 2 0
45 8 45 781 150 -0.816729277586034 0.608443029844731 10 -0.807955860694217 0.614438475439176 30836880 32855615 0.416004881266791 0 0
46 8 46 506 29 -0.171138488053691 0.648516174437777 32 -0.171138488053691 0.648516174437777 33372685 38408323 0.382216262135546 2 0
47 8 47 192 35 -0.729725840991785 0.755445111276056 13 -0.735078137507158 0.755445111276056 38411221 38516569 0.362928954999744 0 0
48 8 48 811 22 -0.0407135060393568 0.62099812714435 38 -0.01937441742574 0.636927515192182 38528399 43356959 0.379170987365012 2 0
49 8 49 2099 146 0.193638950296411 0.105772114724294 44 0.198411361913555 0.10343234674421 47260938 75540186 0.379568843481219 3 1
50 8 50 891 79 0.403024759672806 0.442414856208896 50 0.403024759672806 0.442414856208896 75543862 91986338 0.441998956951174 4 1
51 8 51 2985 248 0.197196993384515 0.110912893819303 44 0.198411361913555 0.10343234674421 91986989 126557446 0.379568843481219 3 1
52 8 52 181 18 1.82215548142346 3.25724001837318 53 1.82215548142346 3.25724001837318 127415930 131040353 0.441595200021458 14 1
53 8 53 2227 249 0.188743474008785 0.119527844230005 44 0.198411361913555 0.10343234674421 131904212 145054185 0.379568843481219 3 1
54 9 54 2430 227 -0.489226782393133 0.239793806384273 21 -0.488404838907414 0.223411649916315 14690 32408682 0.441998956951174 1 0
55 9 55 1734 156 -0.0657667680040231 0.000280597964627875 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 32418213 39150027 1 2 1
56 9 56 257 39 -0.940681844525575 0.0097883026791395 8 -0.940681844525575 0.0097883026791395 39175963 68304338 0.441998956951174 0 0
57 9 57 1400 106 -0.0759508412867753 -0.00550946820395841 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 68357096 84663249 1 2 1
58 9 58 449 46 -0.891477241650366 0.0043810954621335 9 -0.891477241650366 0.0043810954621335 84663554 85587060 0.419949168919765 0 0
59 9 59 2422 222 -0.104597491645936 -0.000293200608964428 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 85588348 104792805 1 2 1
60 9 60 5061 424 0.0213767427191879 -0.00155849507377571 40 0.0270270590336299 0.000681742243898265 104793151 132079678 1 2 1
61 9 61 2625 252 -0.106256184544078 0.00236340159029821 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 132079861 138233830 1 2 1
62 10 62 4809 544 -0.058901338024044 0.596898220280801 34 -0.0673093699507096 0.627062624673822 47140 50093469 0.376642145518936 2 0
63 10 63 239 23 -0.472026700712922 0.144336467364626 21 -0.488404838907414 0.223411649916315 50093873 54664362 0.441998956951174 1 0
64 10 64 9122 773 -0.0509001879944982 0.645628082318049 34 -0.0673093699507096 0.627062624673822 55599937 121473576 0.376642145518936 2 0
65 10 65 166 28 -0.82915043384538 0.631014646402312 10 -0.807955860694217 0.614438475439176 121478450 121598595 0.416004881266791 0 0
66 10 66 1637 192 -0.0858385490862548 0.63807991722505 34 -0.0673093699507096 0.627062624673822 121743838 133626807 0.376642145518936 2 0
67 11 67 7512 770 0.218098470967548 0.102540925053386 44 0.198411361913555 0.10343234674421 192997 49148707 0.379568843481219 3 1
68 11 68 278 6 -0.251752649511867 0.421118598407115 31 -0.221237148251157 NA 49148826 56663671 0.243191589957859 1 0
69 11 69 1579 92 0.22146849081686 0.0754919251364036 44 0.198411361913555 0.10343234674421 56664067 62533691 0.379568843481219 3 1
70 11 70 4678 358 0.324598276996808 0.112456948907526 49 0.324598276996808 0.112456948907526 62534012 75568946 0.441998956951174 3 1
71 11 71 7388 588 0.17381282581942 0.103885761042841 44 0.198411361913555 0.10343234674421 75569215 134387704 0.379568843481219 3 1
72 12 72 2715 268 -0.0129808982551051 0.00629512085534788 39 -0.01937441742574 0.00655797826875317 66816 10805942 1 2 1
73 12 73 600 97 -0.610110163635576 0.00597131436724246 18 -0.610110163635576 0.00597131436724246 10806392 11895336 0.309866412567776 0 0
74 12 74 13130 971 -0.103282412018208 -0.000379773034760229 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 11900376 107710312 1 2 1
75 12 75 4762 334 0.0349506080369118 0.0014495968053814 40 0.0270270590336299 0.000681742243898265 107710630 132077746 1 2 1
76 12 76 434 21 -0.237782800633372 -0.00134622630574951 30 -0.221237148251157 -0.00134622630574951 132139350 133234310 0.127536555331604 0 0
77 13 77 7242 662 -0.315225583011438 0.341111274104457 26 -0.311204587508885 0.341111274104457 19173952 114326389 0.441261241847663 1 0
78 14 78 43 12 -0.728245698406618 0.1332182455508 15 -0.735078137507158 NA 18601149 19747415 0.441998956951174 0 0
79 14 79 3092 321 0.221139704010794 0.107277738366151 44 0.198411361913555 0.10343234674421 19747662 39402538 0.379568843481219 3 1
80 14 80 8517 723 -0.408121391706424 0.233775077315063 23 -0.412932665840492 0.226426875372337 39431468 105529915 0.441595200021458 1 0
81 15 81 11605 987 -0.0691307065952995 0.00250097673003442 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 20534602 87028869 1 2 1
82 15 82 846 105 -1.0849939702003 0.00319558745007564 6 -1.09176718811451 0.00319558745007564 87854626 88146413 0.441998956951174 0 0
83 15 83 1728 168 -0.0631624443200259 0.00255960654330744 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 88146603 101923110 1 2 1
84 16 84 118 22 0.28855385555836 0.13178800523963 47 0.261987398842553 0.12688410170896 47553 261435 0.441998956951174 3 1
85 16 85 1498 127 0.114914226309478 0.160210672529655 42 0.113851879079531 0.151371835821574 261565 2187548 0.157759676063916 3 0
86 16 86 6229 467 0.270152693247534 0.131194927714667 47 0.261987398842553 0.12688410170896 2188930 31914670 0.441998956951174 3 1
87 16 87 7422 628 -0.0113789839213983 0.63962671295458 38 -0.01937441742574 0.636927515192182 31915038 90075983 0.379170987365012 2 0
88 17 88 6435 596 -0.366360836140772 0.243185290802313 24 -0.368912532656817 0.240152135913031 137547 21285072 0.41952359374303 1 0
89 17 89 8747 636 -0.0420586890396169 0.00281505609474549 37 -0.01937441742574 0.0030622593552714 21298407 57401369 1 2 1
90 17 90 6913 711 0.279741070379506 0.117780314725063 46 0.261987398842553 0.108796677837441 57401545 83094678 0.423673850999907 3 1
91 18 91 1764 175 -0.0565538946080541 0.003895061210085 35 -0.0673093699507096 0.00343141665921943 47405 21741826 1 2 1
92 18 92 2140 135 -0.412706556949096 0.200439423302476 23 -0.412932665840492 0.226426875372337 21765755 47249052 0.441595200021458 1 0
93 18 93 129 0 -1.2483207413714 0 4 -1.23220365327252 NA 47249200 47860472 0.441998956951174 0 0
94 18 94 2295 182 -0.386348041478744 0.237048388726644 24 -0.368912532656817 0.240152135913031 47860738 80247160 0.41952359374303 1 0
95 19 95 4355 507 -0.0262907997303469 0.00546000670962011 37 -0.01937441742574 0.0030622593552714 110705 8903263 1 2 1
96 19 96 378 71 -0.667913118270799 8.82609692238977e-05 17 -0.658413000663963 -0.000478020045076792 8903351 9765036 0.309919738974303 0 0
97 19 97 1160 110 -0.000290494363204941 0.00271849410725771 37 -0.01937441742574 0.0030622593552714 9810961 11614979 1 2 1
98 19 98 250 17 -0.746183060093464 0.0293138954132615 14 -0.735078137507158 0.0293138954132615 11616803 12583599 0.354086170887141 0 0
99 19 99 5287 450 -0.00940463846167289 0.00224523515905814 37 -0.01937441742574 0.0030622593552714 12609138 36195198 1 2 1
100 19 100 355 19 -0.559598677053466 -0.0259522089432877 19 -0.563690415757216 0.00574526261827675 36202038 37894797 0.308888526711076 0 0
101 19 101 2128 180 0.0031413824748896 0.0104582474054477 39 -0.01937441742574 0.00655797826875317 37895067 42249497 1 2 1
102 19 102 816 84 -0.280691274393875 0.0100468823690479 27 -0.311204587508885 0.0100468823690479 42249757 44478176 0.163050766977742 0 0
103 19 103 3684 294 0.021797442453604 1.48512887707009e-05 40 0.0270270590336299 0.000681742243898265 44479370 51824682 1 2 1
104 19 104 515 79 -0.651301243201312 0.00656784897200381 16 -0.658413000663963 0.00656784897200381 51824943 53796075 0.344666270522963 0 0
105 19 105 2252 318 -0.120476218853168 0.0125053098150696 33 -0.108696692547883 0.00385465563437793 53798226 58571479 1 2 1
106 20 106 1847 160 -0.356733865717008 0.230300214545925 24 -0.368912532656817 0.240152135913031 87781 15230080 0.41952359374303 1 0
107 20 107 3460 281 0.0182258278313239 0.00474011908933958 40 0.0270270590336299 0.000681742243898265 15431379 40687963 1 2 1
108 20 108 321 34 -0.524751171653625 0.18628680861256 21 -0.488404838907414 0.223411649916315 40688106 42631394 0.441998956951174 1 0
109 20 109 3801 354 0.00078147300459952 0.000326596686117038 37 -0.01937441742574 0.0030622593552714 42677960 64273713 1 2 1
110 21 110 3497 352 -0.0268605563849265 0.672782685498915 38 -0.01937441742574 0.636927515192182 5117166 45505017 0.379170987365012 2 0
111 21 111 505 90 0.278977992731153 1.17416108617674 48 0.261987398842553 1.17416108617674 45505502 46664451 0.441998956951174 3 0
112 22 112 1045 110 -0.0543733453623024 0.643297263588638 34 -0.0673093699507096 0.627062624673822 15528179 20887566 0.376642145518936 2 0
113 22 113 454 60 -0.275154193961423 0.641194488861101 28 -0.311204587508885 0.641194488861101 20887897 23261441 0.441998956951174 1 0
114 22 114 172 30 -0.817946579905681 0.66068036992874 10 -0.807955860694217 0.614438475439176 23261711 23573153 0.416004881266791 0 0
115 22 115 175 23 -0.215650720194949 0.665941083888502 29 -0.221237148251157 0.665941083888502 23573571 23983592 0.386795351040511 2 0
116 22 116 6273 565 -0.0211085393169558 0.629911239665529 38 -0.01937441742574 0.636927515192182 23998657 50782393 0.379170987365012 2 0
117 23 117 197 0 -0.56698036451623 0 20 -0.563690415757216 NA 284229 2726406 0.441998956951174 0 NA
118 23 118 5343 11 -0.218606261726262 0.0679599827063153 31 -0.221237148251157 NA 2733453 66616064 0.243191589957859 0 NA
119 23 119 108 1 -1.23201663877382 29.1393894889007 4 -1.23220365327252 NA 67438120 67703241 0.441998956951174 0 NA
120 23 120 24 0 0.966672800813049 0 52 0.966672800813049 NA 67703651 67709507 0.441595200021458 4 NA
121 23 121 83 2 -1.15849914815239 0.136638844637981 5 -1.15849914815239 NA 67709906 68048516 0.441998956951174 0 NA
122 23 122 1265 0 -0.37387533324305 0 25 -0.368912532656817 NA 68052518 79361537 0.3973210742384 0 NA
123 23 123 5585 7 0.183015567646854 0.0515125689790698 45 0.198411361913555 NA 79362658 155545271 0.298386482193059 2 NA
124 rows