File Info

Filename
1136_3FE-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_3FE-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/platform-users/chnobles/cgp_runs/cgp_dna_exp0024/tools_facets__dde85de3--20260304-153357/variant_calling/facets/1136_3FE-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_3FE-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1/1136_3FE-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_3FE-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Size
16.8 KB
Workflow Run
nobles_exp024_facets_update_02
Published
Mar 04, 2026 8:39 AM

Content

View in new tab
chrom seg num.mark nhet cnlr.median mafR segclust cnlr.median.clust mafR.clust start end cf.em tcn.em lcn.em
1 1 1 23176 2312 0.0311833981111876 0.00051540876008647 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 69270 170995635 1 2 1
2 1 2 13 0 -0.720316692766517 0 10 -0.720316692766517 NA 170996643 171064402 0.259023627387013 0 0
3 1 3 9285 1032 0.047583795438489 0.00066311009968266 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 171092572 248918436 1 2 1
4 2 4 1287 148 0.048434717246968 -0.00326801852578991 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 41602 20260517 1 2 1
5 2 5 11 1 0.98418806183331 -0.128244144867212 34 0.98418806183331 NA 20263091 20297562 0.258924031505209 9 NA
6 2 6 3304 298 0.0468905354900871 -0.00299849540858992 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 20308009 43925980 1 2 1
7 2 7 13 2 -0.889459443764627 -0.00701165055098819 6 -0.905508344739931 NA 43934331 43948484 0.259023627387013 0 0
8 2 8 4225 344 0.0483762365202437 -0.00155793816267769 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 43949709 95935721 1 2 1
9 2 9 10 6 0.3869649949462 0.00878657334038727 32 0.385296733726587 NA 95938843 95951529 0.259023627387013 4 NA
10 2 10 11 2 -0.884158035623844 0.0708672219349061 6 -0.905508344739931 NA 95954105 95980545 0.259023627387013 0 0
11 2 11 6135 627 0.0456415527469747 0.00318440851091801 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 95982328 167243265 1 2 1
12 2 12 11 0 -1.12552652413927 0 3 -1.11097123616119 NA 167243662 167246560 0.258924031505209 0 0
13 2 13 1193 108 0.0984053115598263 0.00506658418773387 27 0.0916779938684111 0.00284758084058348 167247074 177217939 1 2 1
14 2 14 14 0 -0.798343339267674 0 9 -0.770370463111542 NA 177218533 177222576 0.259023627387013 0 0
15 2 15 733 65 0.0508637469705648 0.00204992920345276 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 177230431 178748620 1 2 1
16 2 16 12 0 -1.02775147939442 0 4 -1.04768085089613 NA 178749000 178753037 0.258924031505209 0 0
17 2 17 469 49 0.0754210487966758 -0.00208961976059487 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 178756368 185744528 1 2 1
18 2 18 85 26 -0.76940695266076 0.00327086272140915 8 -0.770370463111542 0.00327086272140915 185745617 185833337 0.259023627387013 0 0
19 2 19 7145 615 0.0670521118198274 0.00297894939827093 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 186486368 241873299 1 2 1
20 3 20 3361 334 0.0488940652179942 0.00181606072565401 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 319841 37323804 1 2 1
21 3 21 17 0 -0.89980681178924 0 6 -0.905508344739931 NA 37324375 37335236 0.259023627387013 0 0
22 3 22 6277 419 0.0630897675583004 0.000733705442540066 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 37337124 87250088 1 2 1
23 3 23 11 1 -0.468184526337321 -0.00499202546449324 12 -0.468184526337321 NA 87253392 87273575 0.173668154696215 0 0
24 3 24 14 0 0.385296733726587 0 32 0.385296733726587 NA 87276475 88086511 0.259023627387013 4 NA
25 3 25 9964 996 0.0708941213208426 -0.000177969361595197 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 88113255 198169947 1 2 1
26 4 26 13167 1283 0.0289856799463848 0.00396565864706611 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 53552 190174800 1 2 1
27 5 27 14741 1511 0.070036639005715 -0.000131528498440173 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 92333 181260811 1 2 1
28 6 28 1955 294 -0.0349623123839597 0.0528073631218476 19 -0.0610198146538942 0.0547436023107796 292608 27456960 1 2 1
29 6 29 4885 616 -0.0189552570935098 0.0121731827611042 23 0.00384886429244621 0.00526995571234834 27457406 46689749 1 2 1
30 6 30 12 2 -0.998158130119714 0.0145576245453452 5 -0.998158130119714 NA 46689840 46693352 0.258924031505209 0 0
31 6 31 1133 114 0.0355190388479735 0.00154322770950898 25 0.0476926621435041 0.00705332010387059 46693499 61894933 1 2 1
32 6 32 334 37 -0.215723063252941 0.066280905773286 15 -0.262220818448238 0.0511783240774312 61901378 70522577 0.259023627387013 1 0
33 6 33 12 0 -1.22453836799887 0 1 -1.23919941544442 NA 70524154 70528576 0.258924031505209 0 0
34 6 34 947 65 -0.1148816356769 0.0642646087454655 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 70533294 84089595 0.258924031505209 1 0
35 6 35 13 0 -0.93676122917757 0 6 -0.905508344739931 NA 84125181 84155561 0.259023627387013 0 0
36 6 36 1905 202 -0.0457818838805484 0.0213660792549099 20 -0.0610198146538942 0.0213660792549099 84160867 111372600 1 2 1
37 6 37 12 0 -1.17042344092824 0 2 -1.16837971072931 NA 111373023 111376356 0.258924031505209 0 0
38 6 38 5467 562 -0.0645050664166953 0.0548500641072465 19 -0.0610198146538942 0.0547436023107796 111376697 170584663 1 2 1
39 7 39 4959 651 0.0571090763791906 0.00306459139493275 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 193265 55028430 1 2 1
40 7 40 168 55 -0.169406306724198 0.000697206648049518 18 -0.120829595513532 0.000697206648049518 55028726 55211656 0.146391088253555 0 0
41 7 41 5635 570 0.0403684629638005 0.000941073131148158 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 55216601 113117605 1 2 1
42 7 42 19 1 -0.768816562324099 -0.0266729804607292 9 -0.770370463111542 NA 113877896 114570759 0.259023627387013 0 0
43 7 43 1543 159 0.0709040298065302 -0.00259569179725321 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 114628672 131487900 1 2 1
44 7 44 12 0 -0.905030301421522 0 6 -0.905508344739931 NA 131488451 131491552 0.259023627387013 0 0
45 7 45 1132 123 0.0714575943820595 0.00496182751281138 25 0.0476926621435041 0.00705332010387059 131491919 140837754 1 2 1
46 7 46 249 30 0.0873249015917622 -0.0154661043142227 27 0.0916779938684111 0.00284758084058348 140850093 142198176 1 2 1
47 7 47 14 0 -1.04532960554615 0 4 -1.04768085089613 NA 142198577 142222044 0.258924031505209 0 0
48 7 48 2017 295 0.0393101923468308 0.000613175749455223 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 142252392 159144683 1 2 1
49 8 49 2800 384 0.0702218807809019 0.00117517289287031 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 166190 30797847 1 2 1
50 8 50 681 108 -0.251475658908735 0.00215097415212735 13 -0.262220818448238 0.00147752317528405 30799694 32854605 0.20990981167747 0 0
51 8 51 430 23 0.0645101572187567 -0.00185153266006221 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 32855011 38408206 1 2 1
52 8 52 161 26 -0.239152507048675 0.00128747144669593 13 -0.262220818448238 0.00147752317528405 38411105 38516623 0.20990981167747 0 0
53 8 53 3980 303 0.0890545136474608 0.00356900003862821 27 0.0916779938684111 0.00284758084058348 38528419 102238801 1 2 1
54 8 54 11 0 -0.759275165012727 0 9 -0.770370463111542 NA 102252441 102257832 0.259023627387013 0 0
55 8 55 3562 377 0.0488308900437188 0.0015745977277235 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 102258913 145054224 1 2 1
56 9 56 4514 452 -0.122435836645079 0.0490624243814877 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 14816 77647785 0.258924031505209 1 0
57 9 57 18 3 -0.943538737229083 0.0265251531297037 6 -0.905508344739931 NA 77647878 77721050 0.259023627387013 0 0
58 9 58 236 26 -0.108665407706376 0.0647550315525092 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 77721323 83837247 0.258924031505209 1 0
59 9 59 367 30 -0.291997890544045 0.0522298113549171 15 -0.262220818448238 0.0511783240774312 83837539 84906996 0.259023627387013 1 0
60 9 60 16 0 -1.23586023631896 0 1 -1.23919941544442 NA 84907466 84911760 0.258924031505209 0 0
61 9 61 122 3 -0.311409001058965 0.036533226846777 16 -0.262220818448238 NA 84912243 85592766 0.259023627387013 1 0
62 9 62 2144 205 -0.133425921373339 0.0573582242689838 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 85596315 105508672 0.258924031505209 1 0
63 9 63 15 0 -0.90540673023856 0 6 -0.905508344739931 NA 105512999 105601453 0.259023627387013 0 0
64 9 64 757 69 -0.0527630924344836 0.067080473142542 19 -0.0610198146538942 0.0547436023107796 105604282 112890211 1 2 1
65 9 65 13 3 -1.15424506018836 0.0024518242599692 2 -1.16837971072931 NA 112890601 113044255 0.258924031505209 0 0
66 9 66 5501 643 -0.12469836949847 0.0553076658116167 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 113049416 138233792 0.258924031505209 1 0
67 10 67 3449 374 0.0890912747405379 -0.000249729537802886 27 0.0916779938684111 0.00284758084058348 47102 46292225 1 2 1
68 10 68 978 117 -0.130897775628245 0.0322848496171414 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 46293916 60778697 0.258924031505209 1 0
69 10 69 14 5 -0.919088373554808 0.0701988343298481 6 -0.905508344739931 NA 60780305 60794993 0.259023627387013 0 0
70 10 70 3905 424 -0.11577229849837 0.0503530708832328 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 60871385 96058360 0.258924031505209 1 0
71 10 71 18 0 -1.12570536836174 0 3 -1.11097123616119 NA 96156460 96192195 0.258924031505209 0 0
72 10 72 3470 297 -0.123804177421464 0.0536891315022551 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 96197037 121551542 0.258924031505209 1 0
73 10 73 108 10 -0.569821849324243 0.04201282927236 11 -0.569821849324243 NA 121556862 121598582 0.259023627387013 0 0
74 10 74 1341 167 -0.149334391544382 0.0453509649235617 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 121743799 133626848 0.258924031505209 1 0
75 11 75 2128 400 0.0366363082457635 0.00284273614409075 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 193166 6932627 1 2 1
76 11 76 16 4 -0.763263665036239 0.0422647397035664 9 -0.770370463111542 NA 6941726 7002609 0.259023627387013 0 0
77 11 77 12 0 0.243403191921612 0 30 0.243403191921612 NA 7002913 7046738 0.259023627387013 3 NA
78 11 78 11 0 -0.784735218411297 0 9 -0.770370463111542 NA 7046904 7062605 0.259023627387013 0 0
79 11 79 9654 858 0.0605680127412056 0.00130681775133985 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 7070418 76454928 1 2 1
80 11 80 10 1 0.880000397614644 0.543835769979351 33 0.880000397614644 NA 76458161 76496447 0.258924031505209 8 NA
81 11 81 6101 622 0.041678537861973 -9.54333052873851e-05 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 76513412 134387760 1 2 1
82 12 82 2283 224 0.0829824460527157 -0.00270789680514336 27 0.0916779938684111 0.00284758084058348 66902 10801923 1 2 1
83 12 83 512 71 -0.0630985650697718 0.000449443666487727 21 -0.0610198146538942 0.000449443666487727 10802256 11895521 1 2 1
84 12 84 1859 172 0.0519037032996669 0.00122249418650467 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 11900534 31728869 1 2 1
85 12 85 14 1 -0.826165108172418 -0.00119018619013099 7 -0.840582211755055 NA 31791149 31983356 0.259023627387013 0 0
86 12 86 1534 232 0.0325623707575242 0.0177708884539678 25 0.0476926621435041 0.00705332010387059 31983779 48970184 1 2 1
87 12 87 1773 174 -0.151171072421711 0.0482820239141536 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 48970608 53523456 0.258924031505209 1 0
88 12 88 255 13 0.0484830262529075 0.0134555907034829 26 0.0476926621435041 NA 53524654 54632314 NA 2 NA
89 12 89 1083 64 0.334038465506329 0.0990222651947773 31 0.334038465506329 0.0990222651947773 54633096 57256057 0.185546770702573 4 1
90 12 90 58 3 0.03544942647738 0.0453784208997042 26 0.0476926621435041 NA 57256358 57467265 NA 2 NA
91 12 91 446 37 0.0273391477009811 -0.00562136413210211 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 57467521 62389759 1 2 1
92 12 92 2054 182 -0.127583836930567 0.0544790273635351 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 62390063 91178638 0.258924031505209 1 0
93 12 93 13 1 -1.04452575785755 0.048927276250238 4 -1.04768085089613 NA 92140371 92144046 0.258924031505209 0 0
94 12 94 6186 553 -0.105256810571892 0.0533953194371717 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 92144451 133234300 0.258924031505209 1 0
95 13 95 3589 368 0.0558453493068406 0.00278168810773281 25 0.0476926621435041 0.00705332010387059 19173964 72757856 1 2 1
96 13 96 12 0 -0.833867912702168 0 7 -0.840582211755055 NA 72758472 72762176 0.259023627387013 0 0
97 13 97 279 20 0.199044389579734 0.0203157626398545 29 0.200535565298207 0.0258213581555928 72763516 77146104 0.176455490899508 3 1
98 13 98 2082 197 0.0712146822203542 -0.00215084810793266 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 77150846 114326256 1 2 1
99 14 99 1978 193 0.0194389315546941 -0.00377017897201504 23 0.00384886429244621 0.00526995571234834 18601305 31846684 1 2 1
100 14 100 17 0 -0.864832316050737 0 7 -0.840582211755055 NA 31850080 32117382 0.259023627387013 0 0
101 14 101 433 28 0.0720076231229761 -0.00373926697073159 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 32146355 37606703 1 2 1
102 14 102 6854 568 0.200558477837614 0.0259753272989842 29 0.200535565298207 0.0258213581555928 37622255 104756560 0.176455490899508 3 1
103 14 103 344 18 0.103663034931637 0.0190249572231662 27 0.0916779938684111 0.00284758084058348 104756880 105529697 1 2 1
104 15 104 1912 223 0.0316482634167348 0.00448995167024419 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 20535527 40620870 1 2 1
105 15 105 16 5 -1.25930567805823 0.077693852842082 1 -1.23919941544442 NA 40621319 40628031 0.258924031505209 0 0
106 15 106 7656 616 0.0344760507138932 0.000655016404108747 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 40628718 86674511 1 2 1
107 15 107 745 110 -0.270075523636789 0.00101568940484252 13 -0.262220818448238 0.00147752317528405 86987929 88146149 0.20990981167747 0 0
108 15 108 1472 179 0.0266320827422285 0.00168829896989003 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 88146556 101923078 1 2 1
109 16 109 12906 1293 0.0399773035508989 3.61355359737237e-05 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 47610 90075951 1 2 1
110 17 110 5405 709 -0.113426207259464 0.0487499843974924 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 137712 21415257 0.258924031505209 1 0
111 17 111 4740 419 0.0453514683392555 0.000476133789410406 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 21415640 43091173 1 2 1
112 17 112 12 3 -1.06043569130112 0.00160297411225797 4 -1.04768085089613 NA 43091484 43094958 0.258924031505209 0 0
113 17 113 8371 917 0.0488861720725219 -0.000402926651123912 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 43095845 82946947 1 2 1
114 17 114 18 4 0.0945356709160899 0.0749431606524224 28 0.0916779938684111 NA 82956867 83094446 NA 2 NA
115 18 115 77 12 -0.058798186790356 0.0267003830433527 22 -0.0610198146538942 NA 47615 627644 0.192739237600615 1 0
116 18 116 1865 159 0.110042111685833 0.0161712520008131 27 0.0916779938684111 0.00284758084058348 633305 26179164 1 2 1
117 18 117 108 8 -0.0728981133066159 0.0757028912196824 22 -0.0610198146538942 NA 26192205 31022542 0.192739237600615 1 0
118 18 118 8 1 -1.11961829288495 -0.0141588667043069 3 -1.11097123616119 NA 31024502 31031207 0.258924031505209 0 0
119 18 119 3248 328 -0.114081702833016 0.0477990327982228 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 31032148 80247398 0.258924031505209 1 0
120 19 120 3669 553 0.0306499050469509 0.000249326834826656 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 110747 8898875 1 2 1
121 19 121 323 15 -0.221353302345795 -0.000141106647542161 14 -0.262220818448238 0.000314565402339586 8899175 9763271 0.214459975133581 0 0
122 19 122 5695 577 0.0138757679890733 0.000111674134276147 23 0.00384886429244621 0.00526995571234834 9764959 36183607 1 2 1
123 19 123 256 32 -0.260765472004527 0.0262490722172524 15 -0.262220818448238 0.0511783240774312 36194187 37647828 0.259023627387013 1 0
124 19 124 20 4 -1.09773163633409 -0.0414863520219781 3 -1.11097123616119 NA 37669281 37740150 0.258924031505209 0 0
125 19 125 13 3 -0.268148123190498 0.00928617495282736 16 -0.262220818448238 NA 37769959 37888028 0.259023627387013 1 0
126 19 126 961 94 0.0191159410382459 0.00424038105465236 23 0.00384886429244621 0.00526995571234834 37888533 40008431 1 2 1
127 19 127 15 1 -1.10710572360521 -0.0478895558936233 3 -1.11097123616119 NA 40013852 40036529 0.258924031505209 0 0
128 19 128 1346 110 0.00477565509549785 -0.00543708681444307 23 0.00384886429244621 0.00526995571234834 40047502 43835639 1 2 1
129 19 129 15 1 -1.05083594393471 -0.0355901643262547 4 -1.04768085089613 NA 43847134 43883946 0.258924031505209 0 0
130 19 130 3390 591 0.0283519844151072 -0.00195792301602503 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 43913453 52064560 1 2 1
131 19 131 309 41 -0.237428613273329 0.00110465961446252 14 -0.262220818448238 0.000314565402339586 52065132 53341352 0.214459975133581 0 0
132 19 132 40 11 -0.866910040603301 -0.00954376901611774 7 -0.840582211755055 NA 53350911 53571822 0.259023627387013 0 0
133 19 133 1912 250 -0.00167411697309718 0.00195395932222779 23 0.00384886429244621 0.00526995571234834 53576813 58571508 1 2 1
134 20 134 7883 828 0.0607920526359054 0.00318238355148887 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 87840 64273630 1 2 1
135 21 135 3374 472 -0.110505464012388 0.0609274087984947 17 -0.120829595513532 0.0518867676799794 5117232 46664411 0.258924031505209 1 0
136 22 136 1258 170 0.0157524950143074 0.00239008954928794 23 0.00384886429244621 0.00526995571234834 15528188 23161060 1 2 1
137 22 137 171 8 -0.275925846372639 0.000869965574755476 16 -0.262220818448238 NA 23161463 23318141 0.259023627387013 1 0
138 22 138 5403 507 0.0492383600209856 0.00394281139996358 24 0.0476926621435041 0.000951303458150238 23573408 50782184 1 2 1
139 23 139 10287 20 -0.0679395276760237 0.0141660743523183 22 -0.0610198146538942 NA 284240 155545320 0.192739237600615 0 NA
140 rows