File Info

Filename
1136_4E9-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_4E9-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/platform-users/chnobles/cgp_runs/cgp_dna_exp0024/tools_facets__dde85de3--20260304-153357/variant_calling/facets/1136_4E9-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_4E9-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1/1136_4E9-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_4E9-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Size
15.9 KB
Workflow Run
nobles_exp024_facets_update_02
Published
Mar 04, 2026 8:40 AM

Content

View in new tab
chrom seg num.mark nhet cnlr.median mafR segclust cnlr.median.clust mafR.clust start end cf.em tcn.em lcn.em
1 1 1 11589 1061 -0.0600799947551148 0.0886139978214341 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 69266 51236792 0.35366516040208 3 1
2 1 2 7219 574 -0.154588879373713 0.207462063511376 28 -0.158011256046422 0.207462063511376 51270001 117368368 0.372663270065273 3 1
3 1 3 2075 127 -0.0526823297334603 0.0261614708828786 34 -0.042787295796905 0.0237910613745136 117402110 152036901 0.207516457959828 4 2
4 1 4 188 19 -0.742553187715888 0.218479265159804 6 -0.738188039874453 0.218479265159804 152079530 152687279 0.372663270065273 1 0
5 1 5 6843 581 0.0456718320595215 0.0192363235865455 37 0.0472123921077915 0.0210907680691016 152698970 192158651 0.188571510973124 5 2
6 1 6 3831 347 -0.0789586724043932 0.0749448590283503 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 192159111 219981426 0.35366516040208 3 1
7 1 7 4032 470 -0.0229795304486749 0.029573458641237 34 -0.042787295796905 0.0237910613745136 219982748 248918436 0.207516457959828 4 2
8 2 8 12 1 0.00830280629790765 -0.0255749443627261 42 0.0472123921077915 NA 41670 231271 0.287025897798881 4 NA
9 2 9 10327 810 0.17783088486118 0.00466610606785788 46 0.180510810763954 0.00477737725898652 233234 97547621 0.372663270065273 4 2
10 2 10 572 64 0.430690840812144 0.0843473780963213 58 0.430690840812144 0.0843473780963213 97547721 100402601 0.364313449917894 6 2
11 2 11 495 54 0.26800630914532 0.00281779315679022 52 0.289351683058712 0.0221831769057641 100402750 106415823 0.364313449917894 5 2
12 2 12 15831 1345 0.033990785820502 0.0193680738034556 37 0.0472123921077915 0.0210907680691016 106416118 241873322 0.188571510973124 5 2
13 3 13 1222 141 -0.313250195486783 0.0762598522743827 18 -0.322982658587631 0.0672975893857617 319810 12288284 1 2 1
14 3 14 484 77 -0.738188039874453 0.0871921831395577 5 -0.738188039874453 0.0871921831395577 12288394 12664264 0.372663270065273 1 0
15 3 15 9049 550 -0.337877854321565 0.0643477459458323 18 -0.322982658587631 0.0672975893857617 12734739 89482264 1 2 1
16 3 16 1089 65 0.305251787977751 0.316939159236175 53 0.289351683058712 0.356142950724033 93874419 108916126 0.364313449917894 5 1
17 3 17 5989 455 0.28206669630704 0.361284847982011 53 0.289351683058712 0.356142950724033 108916315 158824102 0.364313449917894 5 1
18 3 18 3891 336 0.302502168859017 0.231954748113965 54 0.289351683058712 0.202889777763343 158826053 198038561 0.364313449917894 5 1
19 3 19 10 1 0.251927177992021 -0.278987730353534 51 0.240388795973383 NA 198038794 198169735 0.277822170045391 5 NA
20 4 20 1864 267 -0.0986982920705565 0.0909679623287721 29 -0.103717941281589 0.0914316759750497 53544 8949831 0.353325579943834 3 1
21 4 21 28 5 -2.00423146804275 0.0287004135134672 1 -2.00423146804275 NA 8950220 9269184 0.364313449917894 0 0
22 4 22 12167 1110 -0.0975679786077028 0.0853023082989198 29 -0.103717941281589 0.0914316759750497 9444454 184731047 0.353325579943834 3 1
23 4 23 383 54 0.145908030037699 0.00143537625950049 43 0.130989532522728 0.0123164728087234 184734038 186620671 0.220552694043956 5 2
24 4 24 107 12 -0.0398190844573918 0.0134818396475407 36 -0.042787295796905 NA 186621172 190174764 0.372663270065273 3 NA
25 5 25 1938 198 0.0162111004319411 0.10905047566594 39 0.0472123921077915 0.10905047566594 92328 34821720 0.372663270065273 3 1
26 5 26 2112 171 -0.158967368312127 0.0297792551127209 27 -0.158011256046422 0.0384810581667876 34821963 60597850 0.218090753537387 3 1
27 5 27 4090 363 -0.309179273546804 0.00120378237599864 19 -0.322982658587631 0.00820831680192797 60597924 115230951 1 2 1
28 5 28 8160 797 -0.16041729779867 0.0399276975246299 27 -0.158011256046422 0.0384810581667876 115236392 181260906 0.218090753537387 3 1
29 6 29 1247 143 -0.266162946278973 0.0169091279749156 23 -0.21881293489737 0.00692351175105369 292533 17662157 1 2 1
30 6 30 159 19 0.212614746479847 0.276160795970843 49 0.180510810763954 0.275599128438581 17665248 19838759 0.372663270065273 4 1
31 6 31 1142 122 -0.321503168725259 0.0182121871569339 19 -0.322982658587631 0.00820831680192797 20102384 29729492 1 2 1
32 6 32 2625 444 0.13982995878459 0.302490937336922 44 0.130989532522728 0.302490937336922 29738272 35787122 0.368213655338304 4 1
33 6 33 189 15 -0.291999940468647 0.0145246101266764 19 -0.322982658587631 0.00820831680192797 35787218 36470289 1 2 1
34 6 34 611 75 0.178023510040809 0.275323498219726 49 0.180510810763954 0.275599128438581 36474834 39544698 0.372663270065273 4 1
35 6 35 2276 197 -0.0267163088867737 0.0864643645800631 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 39545712 53275204 0.35366516040208 3 1
36 6 36 10 4 -0.31259048231166 0.439610162440095 20 -0.322982658587631 NA 53275363 53295585 NA 2 NA
37 6 37 511 50 -0.641211195967134 0.17550757475851 9 -0.641521776413536 0.168396548063753 53498842 57646188 0.349153141246316 1 0
38 6 38 4723 504 -0.330710211547094 0.559265416695202 17 -0.322982658587631 0.537835542373231 61574301 126348505 0.351149807037899 2 0
39 6 39 115 31 -0.913830856950821 0.572892819073539 3 -0.914696998744681 0.572892819073539 127119184 127155478 0.3376618900598 0 0
40 6 40 4742 406 -0.303550470507956 0.573296636485621 17 -0.322982658587631 0.537835542373231 127195897 170584644 0.351149807037899 2 0
41 7 41 1675 196 0.19754468686927 0.00454873603333715 46 0.180510810763954 0.00477737725898652 193097 12652783 0.372663270065273 4 2
42 7 42 327 98 -0.241031283529815 0.00187266976760408 25 -0.21881293489737 0.00202584804297623 12688201 13990992 1 2 1
43 7 43 15357 1456 0.178584812767818 0.00486250017050224 46 0.180510810763954 0.00477737725898652 13991296 159144724 0.372663270065273 4 2
44 8 44 3015 387 0.240500416158608 0.00318685505998895 50 0.240388795973383 0.00321821636802772 166288 30754680 0.372663270065273 4 2
45 8 45 770 30 -0.24232888877392 0.00278099290354747 25 -0.21881293489737 0.00202584804297623 30754871 32855607 1 2 1
46 8 46 141 15 0.238827255421072 0.00429625155867095 50 0.240388795973383 0.00321821636802772 33372699 37699164 0.372663270065273 4 2
47 8 47 762 43 0.619653870847252 0.349409172139051 61 0.614439866755244 0.349409172139051 37699469 40825757 0.364313449917894 7 2
48 8 48 977 58 0.381136046954271 0.0434652540633115 57 0.381136046954271 0.0434652540633115 41265056 54136564 0.364313449917894 5 2
49 8 49 2100 174 0.0452216952712823 0.0292542670517537 37 0.0472123921077915 0.0210907680691016 54137485 90069269 0.188571510973124 5 2
50 8 50 3815 393 0.331256878643924 0.0459891582153919 55 0.331393558578683 0.0459891582153919 90078482 141477411 0.364313449917894 5 2
51 8 51 1148 163 0.185052751030781 0.038750640485115 48 0.180510810763954 0.0404550943786129 141477756 144523489 0.287045455119793 5 2
52 8 52 124 3 0.340946210477537 0.0798877717044756 56 0.331393558578683 NA 144524096 145054182 0.364313449917894 5 NA
53 9 53 3836 420 -0.338391008089445 0.506794155857691 17 -0.322982658587631 0.537835542373231 14816 39150003 0.351149807037899 2 0
54 9 54 229 41 -0.889692783479594 0.32700938370725 2 -0.914696998744681 0.281136530707259 39175996 68304222 0.343835301258925 0 0
55 9 55 244 23 -0.21938510797319 0.602557494533695 22 -0.21881293489737 0.66349160916038 68357025 70350597 0.372663270065273 2 0
56 9 56 1063 93 0.0243722425554447 0.0141711138583706 37 0.0472123921077915 0.0210907680691016 70352271 84708012 0.188571510973124 5 2
57 9 57 400 27 -0.4830758794366 0.0132219083630745 14 -0.4830758794366 0.0132219083630745 84710816 85095819 0.174204348447179 1 0
58 9 58 168 3 0.0754061903980698 -0.0209924717541847 42 0.0472123921077915 NA 85547199 87605184 0.287025897798881 4 NA
59 9 59 3483 277 -0.348557692117633 0.549265717923943 17 -0.322982658587631 0.537835542373231 87638121 114359560 0.351149807037899 2 0
60 9 60 635 41 0.0167147065258825 0.350596365010022 41 0.0472123921077915 0.350596365010022 114359922 121757108 0.372663270065273 3 1
61 9 61 4937 468 -0.380485591613474 0.566271112737959 15 -0.380797315174962 0.566271112737959 121757298 137716681 0.359659049988602 2 0
62 9 62 138 2 0.0983581498622474 0.00110499115957947 45 0.130989532522728 NA 137717069 138233792 0.301578025051912 4 NA
63 10 63 13032 1107 0.063760230658376 0.0281264348910543 37 0.0472123921077915 0.0210907680691016 47077 121565618 0.188571510973124 5 2
64 10 64 112 20 -0.645862486561448 0.0301232353748774 10 -0.641521776413536 0.0301232353748774 121566127 121598424 0.183661507887583 0 0
65 10 65 1504 224 0.0170523247291673 0.019781238430162 37 0.0472123921077915 0.0210907680691016 121743734 133626807 0.188571510973124 5 2
66 11 66 574 76 -0.0899718936917641 0.107826095738401 29 -0.103717941281589 0.0914316759750497 192997 1003642 0.353325579943834 3 1
67 11 67 585 110 -0.239224753698954 0.0766289905579052 24 -0.21881293489737 0.0766289905579052 1003899 2168085 1 2 1
68 11 68 18534 1947 -0.0448486430500013 0.0941313005846774 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 2168472 134387723 0.35366516040208 3 1
69 12 69 2491 259 0.31310861982519 0.175702888915153 54 0.289351683058712 0.202889777763343 66954 10802203 0.364313449917894 5 2
70 12 70 571 67 -0.115912772844173 0.167001550328386 31 -0.103717941281589 0.167001550328386 10802357 11894684 0.372663270065273 3 1
71 12 71 2229 232 0.291897364141079 0.174501941340497 54 0.289351683058712 0.202889777763343 11894839 34024150 0.364313449917894 5 2
72 12 72 3530 331 0.0336483853449805 0.1613153998288 38 0.0472123921077915 0.1613153998288 34025982 54028860 0.372663270065273 3 1
73 12 73 1935 126 0.196717143233573 0.0179085941669149 48 0.180510810763954 0.0404550943786129 54029693 62349410 0.287045455119793 5 2
74 12 74 548 45 0.6072438000949 0.046290773574372 60 0.614439866755244 0.046290773574372 62355414 68155598 0.364313449917894 7 3
75 12 75 676 80 0.161088214932587 0.088020626077842 48 0.180510810763954 0.0404550943786129 68157848 75048391 0.287045455119793 5 2
76 12 76 7893 678 -0.200869408439582 0.666148194167322 22 -0.21881293489737 0.66349160916038 75050475 133234269 0.372663270065273 2 0
77 13 77 5356 489 0.18231512978852 1.33261429380523 47 0.180510810763954 1.31720694289424 19173968 101706999 0.372663270065273 4 0
78 13 78 270 48 -0.237721378375837 1.25271347075899 26 -0.21881293489737 1.25271347075899 101710807 102863234 0.372663270065273 2 0
79 13 79 1003 146 0.161326858222321 1.27969038910935 47 0.180510810763954 1.31720694289424 102863858 114326389 0.372663270065273 4 0
80 14 80 10599 976 -0.0405901540229663 0.0944499404095867 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 18601123 105529915 0.35366516040208 3 1
81 15 81 17 1 -0.69726710812658 0.302045314642246 8 -0.691354363624129 NA 20535333 22464320 0.372663270065273 1 0
82 15 82 903 92 0.057269806216421 0.533300194744147 40 0.0472123921077915 0.533300194744147 22786749 32396013 0.241811163220332 4 0
83 15 83 9568 769 -0.216133303943863 0.302674917615523 21 -0.21881293489737 0.308620245222929 32396387 87028831 0.271303508694163 2 0
84 15 84 822 81 -0.917455383096399 0.278832246684648 2 -0.914696998744681 0.281136530707259 87854842 88146930 0.343835301258925 0 0
85 15 85 1588 214 -0.188772630182758 0.315832278348078 21 -0.21881293489737 0.308620245222929 88147446 101923016 0.271303508694163 2 0
86 16 86 102 1 0.125262330533426 0.13091619783193 45 0.130989532522728 NA 47424 254607 0.301578025051912 4 NA
87 16 87 2188 295 -0.0147713378254364 0.0135386465305718 34 -0.042787295796905 0.0237910613745136 259535 3735910 0.207516457959828 4 2
88 16 88 6171 459 0.131258689333908 0.0133665882167242 43 0.130989532522728 0.0123164728087234 3736272 56834175 0.220552694043956 5 2
89 16 89 478 66 -0.0697604883186724 0.196187813045016 35 -0.042787295796905 0.196187813045016 56834525 57771712 0.372663270065273 3 1
90 16 90 5198 611 0.0761511542785324 0.0147254411349417 37 0.0472123921077915 0.0210907680691016 57772216 90075728 0.188571510973124 5 2
91 17 91 5885 679 -0.297143242348251 0.516224485203508 17 -0.322982658587631 0.537835542373231 137724 21126931 0.351149807037899 2 0
92 17 92 10252 812 -0.025268753387253 0.0600376042874956 33 -0.042787295796905 0.0600376042874956 21172045 67553484 0.372663270065273 3 1
93 17 93 1403 125 0.112231487731934 0.0126646956966944 43 0.130989532522728 0.0123164728087234 67578288 75524448 0.220552694043956 5 2
94 17 94 2587 371 -0.314225521537422 0.52542179100169 17 -0.322982658587631 0.537835542373231 75543550 82317591 0.351149807037899 2 0
95 17 95 228 43 0.0536070375921208 0.0430091106961338 37 0.0472123921077915 0.0210907680691016 82322236 83094678 0.188571510973124 5 2
96 18 96 2190 211 -0.131349638410054 0.0422177504181705 30 -0.103717941281589 0.0510653998228872 47499 26865665 0.275333702626647 3 1
97 18 97 994 75 -0.558262625383451 0.3027687933159 11 -0.558600921358423 0.3027687933159 26916427 45068634 0.372663270065273 1 0
98 18 98 412 33 -0.269295924424541 0.425974794737772 21 -0.21881293489737 0.308620245222929 45624807 47249012 0.271303508694163 2 0
99 18 99 118 4 -0.936485778582711 0.684308705592225 4 -0.914696998744681 NA 47249268 47848733 0.360438914334366 0 0
100 18 100 289 20 -0.208998486969835 0.580574815503785 22 -0.21881293489737 0.66349160916038 47851233 50729908 0.372663270065273 2 0
101 18 101 780 74 -0.643178381823843 0.164315148989312 9 -0.641521776413536 0.168396548063753 50799384 62211265 0.349153141246316 1 0
102 18 102 1044 115 -0.120319147411117 0.0615323405786803 30 -0.103717941281589 0.0510653998228872 62221132 80247240 0.275333702626647 3 1
103 19 103 3944 579 -0.0687393926616998 0.0896924656002919 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 110784 8882288 0.35366516040208 3 1
104 19 104 401 50 -0.569005213420044 0.104889589923991 12 -0.558600921358423 0.104045126771663 8882623 9811796 0.275707721469295 1 0
105 19 105 1059 85 -0.0292727854691772 0.0912098209587242 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 9818534 11614934 0.35366516040208 3 1
106 19 106 246 36 -0.69291962144401 0.0819065342572877 7 -0.691354363624129 0.0948208489876429 11616662 12629302 0.372663270065273 1 0
107 19 107 4839 517 -0.0350816806281167 0.091644485212339 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 12646724 36194306 0.35366516040208 3 1
108 19 108 336 30 -0.534720499622284 0.0939892499860339 12 -0.558600921358423 0.104045126771663 36194997 37895538 0.275707721469295 1 0
109 19 109 6186 700 -0.0505899181308521 0.0931522330015145 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 37896287 52018505 0.35366516040208 3 1
110 19 110 403 57 -0.695643370843989 0.103062660362279 7 -0.691354363624129 0.0948208489876429 52025821 53577396 0.372663270065273 1 0
111 19 111 2069 308 -0.120608640807155 0.118428421180904 29 -0.103717941281589 0.0914316759750497 53577706 58571479 0.353325579943834 3 1
112 20 112 15 0 -0.00354760300599222 0 36 -0.042787295796905 NA 87625 229374 0.372663270065273 3 NA
113 20 113 1233 130 0.479640236551907 0.140500850201622 59 0.479640236551907 0.140500850201622 229640 8646256 0.364313449917894 6 2
114 20 114 7402 686 0.281384084261363 0.023327142492369 52 0.289351683058712 0.0221831769057641 8647875 64273713 0.364313449917894 5 2
115 21 115 3715 424 -0.23928701459915 0.00302667944524007 23 -0.21881293489737 0.00692351175105369 5117316 46664501 1 2 1
116 22 116 1358 180 -0.0979531820914998 0.078571305948109 29 -0.103717941281589 0.0914316759750497 15528179 23160983 0.353325579943834 3 1
117 22 117 190 36 -0.672656469771584 0.0945203965509141 7 -0.691354363624129 0.0948208489876429 23161079 23573183 0.372663270065273 1 0
118 22 118 5948 739 -0.0172677541712287 0.0930500354438569 32 -0.042787295796905 0.0910762507977714 23573572 50782195 0.35366516040208 3 1
119 23 119 209 0 -0.383134147110167 0 16 -0.380797315174962 NA 284280 2808167 1 1 NA
120 23 120 4739 9 0.0515215226630953 0.0162889641088487 42 0.0472123921077915 NA 2811457 66615942 0.287025897798881 2 NA
121 23 121 204 3 -0.590385353647957 0.155253901826351 13 -0.558600921358423 NA 67438017 68048478 0.279760560207065 0 NA
122 23 122 6173 9 -0.0457242883125973 0.0404893676623655 36 -0.042787295796905 NA 68052622 155545320 0.372663270065273 2 NA
123 rows