File Info

Filename
1136_2QY-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_2QY-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/platform-users/chnobles/cgp_runs/cgp_dna_exp0024/tools_facets__dde85de3--20260304-153357/variant_calling/facets/1136_2QY-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_2QY-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1/1136_2QY-T1-TDNA-1_A23H5VJLT4_1_vs_1136_2QY-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Size
18.5 KB
Workflow Run
nobles_exp024_facets_update_02
Published
Mar 04, 2026 8:40 AM

Content

View in new tab
chrom seg num.mark nhet cnlr.median mafR segclust cnlr.median.clust mafR.clust start end cf.em tcn.em lcn.em
1 1 1 641 52 0.0883621985881612 0.0196564678643196 33 0.123543530465223 0.00822419344756354 69486 1956640 0.280343177766389 3 1
2 1 2 16778 1425 0.00194143283947165 0.0274443751129413 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 1956891 145753095 0.173582412174893 3 1
3 1 3 5562 499 0.0726712434620221 0.0134652146651246 30 0.0568206038437308 0.0145450808429571 145771668 170995595 0.200151930541051 3 1
4 1 4 15 1 -0.669009812191542 -0.0174163631337589 10 -0.665870043155691 NA 170996419 171092882 0.29718511893747 0 0
5 1 5 9202 871 0.040278880663136 0.0151369342600526 30 0.0568206038437308 0.0145450808429571 171101162 248918358 0.200151930541051 3 1
6 2 6 1270 140 0.0707099888063293 -0.000477210088109953 30 0.0568206038437308 0.0145450808429571 41708 20260555 0.200151930541051 3 1
7 2 7 15 0 0.957774962551965 0 48 0.957774962551965 NA 20263413 20308478 0.296026352728778 9 NA
8 2 8 122 4 0.129825659540214 0.0198534750196222 35 0.123543530465223 NA 20311464 21137737 0.29718511893747 3 NA
9 2 9 20 0 -0.726563905188231 0 9 -0.748970074332169 NA 21138289 23562353 0.29718511893747 0 0
10 2 10 7328 708 0.107345489738856 0.00230275932640892 31 0.123543530465223 0.00158327600785261 23562488 95980653 0.149299085584722 4 2
11 2 11 4323 421 0.105559870882255 0.312044691119559 34 0.123543530465223 0.333478491001861 95982328 147896525 0.29718511893747 3 0
12 2 12 21 2 -0.723558941269688 0.1216734327808 9 -0.748970074332169 NA 147899548 147939330 0.29718511893747 0 0
13 2 13 184 12 0.135320860986136 0.33640760983009 35 0.123543530465223 NA 147943457 151458850 0.29718511893747 3 NA
14 2 14 22 1 -0.76333655754546 0.472135295749374 9 -0.748970074332169 NA 151459935 151469827 0.29718511893747 0 0
15 2 15 1481 116 0.148995322647147 0.332560570330654 34 0.123543530465223 0.333478491001861 151474116 167243510 0.29718511893747 3 0
16 2 16 11 0 -1.27034113796484 0 2 -1.27668558664135 NA 167243928 167246746 0.296026352728778 0 0
17 2 17 1924 168 0.160241412521025 0.332443951694558 34 0.123543530465223 0.333478491001861 167247035 178747894 0.29718511893747 3 0
18 2 18 15 0 -0.686012951886852 0 10 -0.665870043155691 NA 178748323 178753176 0.29718511893747 0 0
19 2 19 346 40 0.132983698725089 0.309834091502906 34 0.123543530465223 0.333478491001861 178756197 182730026 0.29718511893747 3 0
20 2 20 207 37 -0.497734675621569 0.330715975450642 11 -0.497734675621569 0.330715975450642 182731147 186501522 0.203825885836745 0 0
21 2 21 1210 131 0.146456177001545 0.35902043258497 34 0.123543530465223 0.333478491001861 186502509 200533154 0.29718511893747 3 0
22 2 22 23 0 -0.677575081575505 0 10 -0.665870043155691 NA 200535031 200597605 0.29718511893747 0 0
23 2 23 1474 85 0.174799091393999 0.284240606549637 37 0.19390474571834 0.265484739146272 200599722 211378697 0.29718511893747 4 1
24 2 24 30 9 -0.672499923072703 0.338216965764514 10 -0.665870043155691 NA 211378978 211431150 0.29718511893747 0 0
25 2 25 4299 475 0.131828493946586 0.356125412418179 34 0.123543530465223 0.333478491001861 211561950 241873391 0.29718511893747 3 0
26 3 26 3362 305 -0.0489568600816015 0.025978568295314 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 319739 37324674 0.173582412174893 3 1
27 3 27 14 2 -1.04074347311254 0.0973962460609235 5 -1.04741127721013 NA 37324968 37335072 0.29718511893747 0 0
28 3 28 1044 122 -0.0121179511011717 0.0211181778819493 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 37337146 44242388 0.173582412174893 3 1
29 3 29 12 2 -0.972736224627984 -0.036533922240865 6 -0.970073762451206 NA 44243092 44256350 0.29718511893747 0 0
30 3 30 5500 370 0.0061457248687163 0.0252976776261457 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 44262440 98088098 0.173582412174893 3 1
31 3 31 22 3 -0.844936954019521 -0.00379217485527911 8 -0.844936954019521 NA 98132864 98283827 0.29718511893747 0 0
32 3 32 866 76 0.0758610882257693 -0.00231121063801486 30 0.0568206038437308 0.0145450808429571 98353898 111647757 0.200151930541051 3 1
33 3 33 8683 758 0.19593783181719 0.0205333714801312 36 0.19390474571834 0.0254954156721292 111649674 198169826 0.212939092528837 4 2
34 4 34 32 2 -1.04280501429563 -0.0533654497224812 5 -1.04741127721013 NA 53508 444424 0.29718511893747 0 0
35 4 35 7223 719 -0.143591912592386 -0.00232153420449595 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 499287 89895520 1 2 1
36 4 36 17 0 -0.956610802941768 0 6 -0.970073762451206 NA 89909406 89953518 0.29718511893747 0 0
37 4 37 2813 199 -0.140831577596858 0.00364311533770825 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 90308324 142023948 1 2 1
38 4 38 20 5 -0.980769542167693 -0.00335266448351514 6 -0.970073762451206 NA 142024216 142029927 0.29718511893747 0 0
39 4 39 2861 279 -0.127326181364369 -0.00478130383694506 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 142030208 190027194 1 2 1
40 5 40 14031 1357 0.0595480084363754 0.072751549443088 29 0.0568206038437308 0.072385969858479 92316 178866942 0.29718511893747 3 1
41 5 41 11 1 -1.03274358045183 0.388921652458353 5 -1.04741127721013 NA 178882853 178932476 0.29718511893747 0 0
42 5 42 523 67 0.0507438184114484 0.0663485784192132 29 0.0568206038437308 0.072385969858479 178932712 181260817 0.29718511893747 3 1
43 6 43 8276 989 -0.108856121244402 0.0108285733511317 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 292442 70491055 1 2 1
44 6 44 15 1 -1.30240640516922 0.134764411877294 2 -1.27668558664135 NA 70502826 70528512 0.296026352728778 0 0
45 6 45 1615 134 -0.154603031072316 0.00456528722003132 19 -0.168378548616623 0.00287583305198692 70533198 90586862 1 2 1
46 6 46 13 1 -1.14888040345404 -0.000275713964879911 4 -1.13645622217962 NA 93240013 93243657 0.29718511893747 0 0
47 6 47 1192 99 -0.16300274864179 0.00447882933106549 19 -0.168378548616623 0.00287583305198692 93245407 111373218 1 2 1
48 6 48 12 2 -1.11554300632881 0.0391560573870293 4 -1.13645622217962 NA 111373401 111376707 0.29718511893747 0 0
49 6 49 5388 597 -0.12104672648061 0.00635861208503929 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 111377661 170584536 1 2 1
50 7 50 7519 869 -0.00861791592347072 0.0249491405397671 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 193205 92841495 0.173582412174893 3 1
51 7 51 13 0 -1.49754951802688 0 1 -1.49754951802688 NA 93101430 93104868 0.296026352728778 0 0
52 7 52 4653 395 0.0147562259569274 0.0223101389965978 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 93105138 131488480 0.173582412174893 3 1
53 7 53 12 2 -1.07271749540757 0.0105145802018293 5 -1.04741127721013 NA 131488791 131491794 0.29718511893747 0 0
54 7 54 1371 102 0.0199539924891207 0.0188516022509086 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 131492088 142198718 0.173582412174893 3 1
55 7 55 16 3 -0.807903567334089 0.0785689279786486 8 -0.844936954019521 NA 142199882 142255430 0.29718511893747 0 0
56 7 56 1508 180 0.0166915221240279 0.015214394039964 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 142255587 152230422 0.173582412174893 3 1
57 7 57 8 2 0.814532017649163 -0.00994525770122284 46 0.814532017649163 NA 152235689 152244929 0.296026352728778 8 NA
58 7 58 507 57 0.0164915608665304 0.0304769915779658 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 152245320 159144724 0.173582412174893 3 1
59 8 59 2764 401 -0.136150330991355 -0.000876145256918127 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 166288 30794159 1 2 1
60 8 60 525 25 -0.44278907631453 -0.00181635008307638 12 -0.44278907631453 -0.00181635008307638 30797743 32717948 0.239735650378744 0 0
61 8 61 11 0 -1.18298136772524 0 3 -1.18298136772524 NA 32718180 32721024 0.296026352728778 0 0
62 8 62 74 4 -0.207447908077897 0.00145784831153293 22 -0.168378548616623 NA 32721510 32743368 NA 2 NA
63 8 63 701 52 -0.262607547918312 0.000499371444661798 15 -0.287470170780898 0.000499371444661798 32743776 38819466 0.179312699917365 1 0
64 8 64 2294 173 -0.105287380747938 0.000897004232921576 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 38819785 73981645 1 2 1
65 8 65 534 49 0.214432772145192 0.188104661511404 37 0.19390474571834 0.265484739146272 73991466 88197354 0.29718511893747 4 1
66 8 66 540 40 -0.291993252965264 0.0766706253199539 14 -0.287470170780898 0.0342688516162374 88327244 95269243 0.246650884944088 1 0
67 8 67 209 25 0.330635271957527 0.310167501328046 40 0.326621910574097 0.310167501328046 96144740 98883838 0.29718511893747 4 1
68 8 68 191 14 -0.323252534261414 0.0549708978488493 16 -0.287470170780898 NA 98948210 100225442 0.25289892016032 1 0
69 8 69 238 28 0.630775667857132 0.495744184054113 44 0.626607956838876 0.605053383991128 100231273 102655590 0.296026352728778 7 2
70 8 70 632 84 -0.235383969080567 0.0487216167849762 17 -0.233075016358252 0.0487216167849762 102828728 115667832 0.198066616052284 1 0
71 8 71 1217 122 0.625808940799048 0.649697283605676 44 0.626607956838876 0.605053383991128 116645037 133212736 0.296026352728778 7 1
72 8 72 1603 125 0.144882292753868 0.0712108555759974 32 0.123543530465223 0.0760246830823723 133213102 145054241 0.29718511893747 3 1
73 9 73 1704 188 0.12489728129968 0.0678549182276334 32 0.123543530465223 0.0760246830823723 14889 21481727 0.29718511893747 3 1
74 9 74 15 4 -0.393283188112237 0.036424144646965 13 -0.393283188112237 NA 21797660 21854897 0.29718511893747 1 0
75 9 75 105 6 -0.658771724114721 0.0471949645463181 10 -0.665870043155691 NA 21859293 22012150 0.29718511893747 0 0
76 9 76 213 28 0.104851267186818 0.0962553351149743 32 0.123543530465223 0.0760246830823723 22447111 32459452 0.29718511893747 3 1
77 9 77 3173 332 -0.135444431695334 0.0185958758439866 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 32459566 85619326 1 2 1
78 9 78 2006 187 -0.0221506199487349 0.0233603768822277 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 85621230 104784539 0.173582412174893 3 1
79 9 79 6400 609 0.139452499606183 0.0793727696674333 32 0.123543530465223 0.0760246830823723 104785556 138233797 0.29718511893747 3 1
80 10 80 4344 501 0.00563877346580372 0.0252086346730329 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 47042 60778720 0.173582412174893 3 1
81 10 81 16 0 -0.898258042290756 0 7 -0.898258042290756 NA 60780252 60871462 0.29718511893747 0 0
82 10 82 8794 934 -0.00658344589821856 0.0287925676789225 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 60871709 133626824 0.173582412174893 3 1
83 11 83 1319 216 0.0117727572877578 0.0162122330953648 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 193112 3669405 0.173582412174893 3 1
84 11 84 519 95 0.156153107050072 0.0209064109638967 33 0.123543530465223 0.00822419344756354 3669791 6224338 0.280343177766389 3 1
85 11 85 1250 177 0.00803054646109743 0.0252553794518909 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 6224555 13417349 0.173582412174893 3 1
86 11 86 12 1 0.985251396971078 0.093990502993577 48 0.957774962551965 NA 13419589 13695038 0.296026352728778 10 NA
87 11 87 1042 96 -0.0413703404492936 0.0223800375706964 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 13700256 22227554 0.173582412174893 3 1
88 11 88 10 0 -0.986292032524382 0 6 -0.970073762451206 NA 22236130 22259478 0.29718511893747 0 0
89 11 89 573 56 -0.0971852983084825 0.0160945543557634 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 22259825 33339334 1 2 1
90 11 90 5525 457 0.0522865899093641 0.0204888037198879 30 0.0568206038437308 0.0145450808429571 33339600 67507660 0.200151930541051 3 1
91 11 91 1579 135 -0.015266651673498 0.0228812397305957 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 67507924 76454928 0.173582412174893 3 1
92 11 92 10 1 0.888659192416534 0.10386395624545 47 0.888659192416534 NA 76458161 76496547 0.296026352728778 9 NA
93 11 93 1635 154 -0.0488678094622336 0.0149195943109593 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 76513444 101034596 0.173582412174893 3 1
94 11 94 13 2 -0.990503167095065 -0.00573425474723569 6 -0.970073762451206 NA 101035002 101038646 0.29718511893747 0 0
95 11 95 4385 416 -0.0140802009544896 0.0201003408898345 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 101038833 134387739 0.173582412174893 3 1
96 12 96 2065 260 0.377263238566434 0.0468714334935646 41 0.385567161099755 0.0551487089645617 66916 9718648 0.296026352728778 5 2
97 12 97 1342 223 -0.186964939505042 0.125968783222814 20 -0.168378548616623 0.125479508409559 9722674 19270169 0.175286352403056 2 0
98 12 98 914 59 0.147625378990468 0.0974596172569207 32 0.123543530465223 0.0760246830823723 19274627 28304693 0.29718511893747 3 1
99 12 99 449 56 -0.0995960145766783 0.120572553636833 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 28305781 34027020 0.170327528554565 2 0
100 12 100 614 104 0.260739674062094 0.0401627595544268 38 0.256265198878559 0.0152710735608358 38316781 43551988 0.174363151612181 5 2
101 12 101 243 5 -0.228715299545103 0.0308149059326314 18 -0.233075016358252 NA 43730482 46361219 NA 2 NA
102 12 102 14 2 -1.13649473146996 0.280936972400668 4 -1.13645622217962 NA 46362254 46370826 0.29718511893747 0 0
103 12 103 2594 241 -0.103880787838576 0.132477394196502 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 46371308 55452619 0.170327528554565 2 0
104 12 104 10 4 -0.950897790802165 0.141352440600336 6 -0.970073762451206 NA 55452839 55493199 0.29718511893747 0 0
105 12 105 174 6 -0.0651291292629226 0.0639020369343662 28 -0.00732767887150657 NA 55551329 55967213 NA 2 NA
106 12 106 1820 81 0.395418961156538 0.0770982233888243 41 0.385567161099755 0.0551487089645617 55968063 67657097 0.296026352728778 5 2
107 12 107 44 0 0.627697670201354 0 45 0.626607956838876 NA 67657540 68332315 0.296026352728778 7 NA
108 12 108 280 32 0.223139531511245 0.0791597450035205 36 0.19390474571834 0.0254954156721292 68648838 70430700 0.212939092528837 4 2
109 12 109 1224 98 -0.165922320194725 0.117810017460375 20 -0.168378548616623 0.125479508409559 70521448 91178586 0.175286352403056 2 0
110 12 110 13 0 -1.27668558664135 0 2 -1.27668558664135 NA 92140188 92143904 0.296026352728778 0 0
111 12 111 845 75 -0.13378982707331 0.125386813503031 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 92144027 101168140 0.170327528554565 2 0
112 12 112 709 79 0.325084718315259 0.100126446263886 39 0.326621910574097 0.100126446263886 101180034 106106594 0.29718511893747 4 2
113 12 113 4511 411 -0.102196316642919 0.129404133534464 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 106138376 133234363 0.170327528554565 2 0
114 13 114 3538 326 -0.162086440013236 0.0017087970521913 19 -0.168378548616623 0.00287583305198692 19173890 72757256 1 2 1
115 13 115 10 1 -1.27974154346964 -0.0101344367618511 2 -1.27668558664135 NA 72757673 72760771 0.296026352728778 0 0
116 13 116 2310 228 -0.146413490909081 0.00400789932444825 23 -0.117625302703307 0.00643080713067388 72761401 114326308 1 2 1
117 14 117 1983 212 0.00271577360569933 0.0327883109836431 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 18601349 31846695 0.173582412174893 3 1
118 14 118 16 0 -0.81680719981459 0 8 -0.844936954019521 NA 31850092 32094488 0.29718511893747 0 0
119 14 119 7553 738 -0.0321454158614681 0.0385287480896857 27 -0.00732767887150657 0.0385287480896857 32117243 105529705 0.21753961950226 3 1
120 15 120 1919 235 0.0935550365905679 0.00784318762022277 33 0.123543530465223 0.00822419344756354 20535333 40618984 0.280343177766389 3 1
121 15 121 18 1 -1.03596185730383 0.0580534998253656 5 -1.04741127721013 NA 40620794 40625724 0.29718511893747 0 0
122 15 122 7596 560 0.10212236099403 0.00422644592269449 33 0.123543530465223 0.00822419344756354 40628163 87860691 0.280343177766389 3 1
123 15 123 763 114 -0.173222643626307 0.000977969785461809 21 -0.168378548616623 0.000977969785461809 87861160 88146413 1 2 1
124 15 124 1463 206 0.08628742262072 0.00163033230397602 31 0.123543530465223 0.00158327600785261 88146621 101922988 0.149299085584722 4 2
125 16 125 6632 553 0.248838981569143 0.00925821907616098 38 0.256265198878559 0.0152710735608358 47354 31885235 0.174363151612181 5 2
126 16 126 6232 726 0.0100747304830951 0.0316438573912142 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 31914519 90075910 0.173582412174893 3 1
127 17 127 5436 598 -0.101304871423041 0.110069697242764 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 137592 27303628 0.170327528554565 2 0
128 17 128 3530 287 0.117783790173111 0.00253422601729428 31 0.123543530465223 0.00158327600785261 27304808 41041136 0.149299085584722 4 2
129 17 129 6921 667 -0.11755396181188 0.118854205090354 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 41041414 75286786 0.170327528554565 2 0
130 17 130 2662 282 0.271823945456914 0.0209814847227252 38 0.256265198878559 0.0152710735608358 75320600 83094462 0.174363151612181 5 2
131 18 131 1328 185 -0.284504819707255 0.0303677526539634 14 -0.287470170780898 0.0342688516162374 47492 21042662 0.246650884944088 1 0
132 18 132 1345 104 -0.0699471368806169 0.0039135869038694 26 -0.00732767887150657 0.0255019908748403 21044013 41970278 0.173582412174893 3 1
133 18 133 2509 273 -0.293107338252765 0.0326233756898051 14 -0.287470170780898 0.0342688516162374 41970550 80247384 0.246650884944088 1 0
134 19 134 298 47 0.585915210301722 0.160626835240602 43 0.585915210301722 0.160626835240602 110838 885101 0.296026352728778 6 2
135 19 135 8138 982 -0.118575673381458 0.123096016911105 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 885118 24126938 0.170327528554565 2 0
136 19 136 2450 268 0.538547152765783 0.224865309731037 42 0.538547152765783 0.224865309731037 29207694 39863983 0.296026352728778 6 2
137 19 137 1450 118 -0.109075225768968 0.0926983692376685 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 39866927 43846955 0.170327528554565 2 0
138 19 138 13 4 -1.12087702656711 0.105828480194349 4 -1.13645622217962 NA 43847248 43883958 0.29718511893747 0 0
139 19 139 5732 716 -0.119543562260455 0.109494573856731 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 43913423 58571492 0.170327528554565 2 0
140 20 140 7837 790 -0.111585484859528 0.120686673609511 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 87840 64273513 0.170327528554565 2 0
141 21 141 2528 311 -0.118048924016859 0.126974394998109 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 5117070 44107443 0.170327528554565 2 0
142 21 142 22 1 -1.14561258617738 0.370677173956909 4 -1.13645622217962 NA 44224622 44254746 0.29718511893747 0 0
143 21 143 771 135 -0.129941065185709 0.0863870194320619 24 -0.117625302703307 0.118279716117934 44255994 46664268 0.170327528554565 2 0
144 22 144 1244 151 0.121475704886247 -0.000613634483795815 31 0.123543530465223 0.00158327600785261 15528179 23161464 0.149299085584722 4 2
145 22 145 175 60 -0.130355387481366 0.00196912701639281 25 -0.117625302703307 0.00196912701639281 23180486 23318049 1 2 1
146 22 146 5416 618 0.152794446195451 0.000895783439191598 31 0.123543530465223 0.00158327600785261 23573430 50782206 0.149299085584722 4 2
147 23 147 10146 27 -0.0253757264101995 0.0232922703348632 28 -0.00732767887150657 NA 284298 155545322 1 1 NA
148 rows