File Info

Filename
869_P6B-T1-TDNA-1_B23KKT2LT4_1_vs_869_P6B-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Full Path
s3://natera-platform-sandbox/platform-users/chnobles/cgp_runs/cgp_dna_exp0024/tools_facets__d1502129--20260304-172928/variant_calling/facets/869_P6B-T1-TDNA-1_B23KKT2LT4_1_vs_869_P6B-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1/869_P6B-T1-TDNA-1_B23KKT2LT4_1_vs_869_P6B-N1-BDNA-1_A237CFYLT3_1.segments.csv
Size
16.6 KB
Workflow Run
nobles_exp024_facets_update_03
Published
Mar 04, 2026 10:40 AM

Content

View in new tab
chrom seg num.mark nhet cnlr.median mafR segclust cnlr.median.clust mafR.clust start end cf.em tcn.em lcn.em
1 1 1 14131 1663 0.0496915925614428 0.000990345332821457 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 925875 66534389 1 2 1
2 1 2 1555 169 -0.109266032508712 0.00613314095477551 19 -0.109266032508712 0.0132609936142445 66625731 86355296 0.167301682162571 1 0
3 1 3 21314 2375 0.0492668428555771 0.00192761341363411 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 86356540 248918370 1 2 1
4 2 4 1485 154 -0.0170816046089505 0.00281453196037679 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 41662 20260517 1 2 1
5 2 5 12 0 0.950326422221541 0 47 0.950326422221541 NA 20263331 20297708 0.327721375576283 7 NA
6 2 6 15660 1719 -0.0278077904227882 0.00290665516749873 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 20307875 167243286 1 2 1
7 2 7 14 0 -1.04722550630353 0 1 -1.04722550630353 NA 167243587 167247033 0.327721375576283 0 0
8 2 8 2745 253 -0.060140864842455 0.00710812804451307 21 -0.0688206628949619 0.00627253086448103 167247385 183151757 1 2 1
9 2 9 136 31 -0.57745989381296 0.0034116774885001 6 -0.556459920853797 0.0034116774885001 183157550 186500392 0.327721375576283 0 0
10 2 10 8190 997 -0.00592066345494338 0.00358748273853806 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 186501225 241873293 1 2 1
11 3 11 1259 136 0.0146387170719729 0.0138955182740346 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 319825 12190708 1 2 1
12 3 12 344 35 -0.335164875561281 0.00259696728596837 9 -0.341668389194708 0.00346965622444364 12287358 12378798 0.222442760312971 0 0
13 3 13 3831 385 -0.00817391049101276 0.00289731844080389 24 -0.0181585869172056 -0.000148105152755852 12379076 45677110 1 2 1
14 3 14 459 47 -0.13121573187579 0.0366933066101415 19 -0.109266032508712 0.0132609936142445 45677146 47120829 0.167301682162571 1 0
15 3 15 8 1 -1.05083699860788 0.104798641020126 1 -1.04722550630353 NA 47121035 47122902 0.327721375576283 0 0
16 3 16 4160 292 -0.164790358393134 0.0358425015078633 14 -0.191688519388406 0.0418297562236695 47123158 64198667 0.311457416285211 1 0
17 3 17 12430 1324 -0.0319614047146295 0.00583895638434863 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 64199000 198169947 1 2 1
18 4 18 15034 1760 -0.014530517618333 0.00147881150829145 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 53552 190174779 1 2 1
19 5 19 3986 523 0.0314262202612037 0.000757739099420759 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 92349 56533168 1 2 1
20 5 20 4713 558 -0.0982208218400289 0.0117881161759768 19 -0.109266032508712 0.0132609936142445 56535210 119177553 0.167301682162571 1 0
21 5 21 8190 995 0.00998701673877168 0.00376724680561192 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 119178131 181260670 1 2 1
22 6 22 8902 1178 0.0260771150003683 0.00502120901704686 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 292658 56618448 1 2 1
23 6 23 47 7 -0.258120108847556 -0.0196597264553325 13 -0.254624794167493 NA 56618918 56648533 0.306801888967166 1 0
24 6 24 300 24 -0.153150331775999 0.0142088630688033 14 -0.191688519388406 0.0418297562236695 56648745 68930782 0.311457416285211 1 0
25 6 25 13 1 0.688863353876319 -0.0406817744461655 42 0.654355093203093 NA 68936583 68993993 0.327721375576283 6 NA
26 6 26 4031 405 -0.0657095948943196 0.00696528065456313 22 -0.0688206628949619 0.0142759966543995 69014158 117288601 1 2 1
27 6 27 893 93 -0.215472171066067 -0.00349475079216389 16 -0.191688519388406 0.00216676299976379 117288714 127855287 0.165581044313547 0 0
28 6 28 2551 286 -0.0138377590546156 0.00270165525194766 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 127900934 151573599 1 2 1
29 6 29 6 3 0.662175619926418 0.0559615802954252 42 0.654355093203093 NA 151585949 151596687 0.327721375576283 5 NA
30 6 30 2266 311 0.0450296925728042 0.00574192686418915 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 151615576 170584647 1 2 1
31 7 31 1728 268 0.050986709787319 0.00310851475954154 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 193140 12652783 1 2 1
32 7 32 337 128 -0.224811808287891 0.00164047401161928 16 -0.191688519388406 0.00216676299976379 12688174 13985692 0.165581044313547 0 0
33 7 33 15939 1839 0.0187912321369934 0.00118955995234017 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 13986015 159144665 1 2 1
34 8 34 2070 319 -0.113690763821707 0.0566927268758259 20 -0.109266032508712 0.0512504766606036 166190 23200675 0.211384402070623 1 0
35 8 35 186 19 0.277250859398949 0.0766024645767115 32 0.256249178481206 0.0761405236796269 23201960 24399063 0.317763160521969 3 1
36 8 36 910 97 -0.0488558128190461 0.0462509344466856 22 -0.0688206628949619 0.0142759966543995 24399484 30794178 1 2 1
37 8 37 785 171 -0.552697422647454 0.0694298677081042 5 -0.556459920853797 0.0694298677081042 30794343 32854784 0.327721375576283 0 0
38 8 38 135 23 -0.0603270749855072 0.0597216382713571 22 -0.0688206628949619 0.0142759966543995 32855093 36935940 1 2 1
39 8 39 1324 112 0.426423823646096 0.275034309611589 34 0.426659426492253 0.263104089062555 37695929 47700499 0.327721375576283 4 1
40 8 40 7968 928 0.0264302833225838 0.00109426481080834 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 47701820 145054241 1 2 1
41 9 41 5484 637 -0.031249129154325 0.0111433800220749 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 14701 83956426 1 2 1
42 9 42 521 100 -0.255966768643918 0.00361071641556546 11 -0.254624794167493 0.00361071641556546 83956584 85547121 0.207999027348342 0 0
43 9 43 9636 1030 0.00606468595171539 0.00296288581663467 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 85547358 138221146 1 2 1
44 10 44 3396 380 0.0212793871948444 0.000277590188297628 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 47183 37149797 1 2 1
45 10 45 3759 436 -0.189397267120739 0.0400422070954566 14 -0.191688519388406 0.0418297562236695 37149893 77025563 0.311457416285211 1 0
46 10 46 32 1 0.100757544060863 -0.00746534408690214 29 0.11348290464122 NA 77027755 77637625 NA 2 NA
47 10 47 139 15 0.891929011971567 0.877193173384021 46 0.869684172746473 0.783831151651709 77792552 79292339 0.327721375576283 7 1
48 10 48 184 27 0.22853336746946 0.154650425191446 30 0.21432312217616 0.128636374320118 79293425 80427589 0.327721375576283 3 1
49 10 49 7594 913 -0.200441726436578 0.0448388588940875 14 -0.191688519388406 0.0418297562236695 80431921 133626807 0.311457416285211 1 0
50 11 50 8486 1227 -0.00218154521917341 0.00572090087298443 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 192997 61304099 1 2 1
51 11 51 1659 138 0.099530821943646 0.00266666900948868 27 0.11348290464122 0.00812075895090372 61309037 64896918 1 2 1
52 11 52 220 23 0.314439901492853 0.0462731424892968 33 0.325402419727445 0.106782176374913 64897302 65133453 0.327721375576283 3 1
53 11 53 2016 190 0.135931407339983 0.00255190661680277 27 0.11348290464122 0.00812075895090372 65133670 70422974 1 2 1
54 11 54 1051 139 -0.0159421593095957 0.016348257808917 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 70425311 75450004 1 2 1
55 11 55 7025 807 -0.253786046275914 0.159805322407763 10 -0.254624794167493 0.16042460497462 75456880 134387737 0.327721375576283 1 0
56 12 56 2233 305 0.00155623389791748 0.0115092081107723 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 66973 9101608 1 2 1
57 12 57 4555 623 -0.10746210545981 0.0140628858183839 19 -0.109266032508712 0.0132609936142445 9104345 48107339 0.167301682162571 1 0
58 12 58 13783 1438 0.0291025918328023 0.00317409903665527 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 48107561 133234306 1 2 1
59 13 59 5049 498 -0.0712352149525554 0.0126966006412111 22 -0.0688206628949619 0.0142759966543995 19173949 96832385 1 2 1
60 13 60 585 65 0.453484195574203 0.228686660924111 34 0.426659426492253 0.263104089062555 96832630 102597257 0.327721375576283 4 1
61 13 61 309 42 -0.262471861540687 0.037644501020966 12 -0.254624794167493 0.037644501020966 102604860 108303189 0.197421807201514 0 0
62 13 62 423 67 0.114428268570455 0.0329779856472444 27 0.11348290464122 0.00812075895090372 108303585 112587853 1 2 1
63 13 63 492 60 -0.179056401820441 0.0646998460139248 17 -0.191688519388406 0.0787088453181781 112588092 114326357 0.321590680369429 1 0
64 14 64 7052 770 0.016587714221268 0.00372244768346205 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 18601276 75046581 1 2 1
65 14 65 9 1 -1.00659437509996 -0.00505056917714884 2 -1.00659437509996 NA 75046861 75048945 0.327721375576283 0 0
66 14 66 417 43 0.107033728332193 0.0244196253884456 28 0.11348290464122 0.0275972303379492 75049297 77433931 1 2 1
67 14 67 1961 227 -0.119177508998796 0.0433417534088144 20 -0.109266032508712 0.0512504766606036 77434147 99271350 0.211384402070623 1 0
68 14 68 1507 236 0.0333858568762351 0.00185649300384388 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 99398752 105529915 1 2 1
69 15 69 10829 1150 0.0630066863040895 0.00314648575301155 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 20535499 86988081 1 2 1
70 15 70 872 194 -0.219983386422793 0.00312743190462204 16 -0.191688519388406 0.00216676299976379 86988212 88147106 0.165581044313547 0 0
71 15 71 1645 251 0.0699348842918949 0.00423002188421246 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 88147269 101923026 1 2 1
72 16 72 14589 1731 0.0500002431656629 0.00428351163621549 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 47486 90075937 1 2 1
73 17 73 6344 846 -0.0200241015766318 0.0126736870539632 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 137547 28325466 1 2 1
74 17 74 448 13 0.201037613575585 0.00287034976683973 31 0.21432312217616 NA 28325723 28889124 0.257741608940302 3 NA
75 17 75 616 61 0.404992353440747 0.168819249561796 35 0.426659426492253 0.168819249561796 28897532 31095282 0.25816517802568 4 1
76 17 76 407 46 -0.216939139306211 0.0348333711862811 14 -0.191688519388406 0.0418297562236695 31095514 32350244 0.311457416285211 1 0
77 17 77 91 9 0.487629482555481 0.262657458980317 37 0.498367390818624 NA 32351752 32933237 0.327721375576283 4 NA
78 17 78 113 16 -0.266638509383245 0.210467916668493 10 -0.254624794167493 0.16042460497462 32933404 34959685 0.327721375576283 1 0
79 17 79 461 39 0.770787275008742 0.646818176089466 43 0.766932720838091 0.646818176089466 34961195 36105356 0.327721375576283 6 1
80 17 80 411 28 0.212108480419394 0.100638560345267 30 0.21432312217616 0.128636374320118 36165944 38318702 0.327721375576283 3 1
81 17 81 254 27 1.07299514097792 1.02322584035285 49 1.07299514097792 1.02322584035285 38320523 38870208 0.327721375576283 8 1
82 17 82 243 21 0.0385379869524753 0.0602640199482361 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 38878022 39630152 1 2 1
83 17 83 220 19 0.819308095035748 0.760828990083575 45 0.819308095035748 0.760828990083575 39633771 39966455 0.327721375576283 6 1
84 17 84 1695 233 -0.216682911610034 0.159124483767365 15 -0.191688519388406 0.161825240800357 39970566 42745173 0.327721375576283 1 0
85 17 85 2099 216 0.0126282868303119 0.0192860570144611 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 42761348 49045163 1 2 1
86 17 86 926 97 0.327179284049913 0.121101171687141 33 0.325402419727445 0.106782176374913 49046030 55160001 0.327721375576283 3 1
87 17 87 10 1 1.56181889230083 2.12350102505231 53 1.56181889230083 NA 55265471 55394523 0.327721375576283 13 NA
88 17 88 616 69 0.863899485258379 0.770540623412864 46 0.869684172746473 0.783831151651709 55401541 58966006 0.327721375576283 7 1
89 17 89 499 40 1.16718995475988 1.47938438940951 50 1.14956099825109 1.37523401336064 58969518 61015971 0.327721375576283 9 1
90 17 90 542 68 0.251670449617279 0.0993047244870197 32 0.256249178481206 0.0761405236796269 61026884 63652767 0.317763160521969 3 1
91 17 91 463 53 0.500855799487335 0.271222341958921 36 0.498367390818624 0.271222341958921 63657834 64855789 0.327721375576283 4 1
92 17 92 66 14 0.224376800870677 0.212953120164073 31 0.21432312217616 NA 64856017 65160999 0.257741608940302 3 NA
93 17 93 123 6 0.603775823990063 0.808785605166274 40 0.594974755214958 NA 65163105 66496354 0.327721375576283 5 NA
94 17 94 297 36 1.00699912403709 0.981935724421327 48 1.00699912403709 0.981935724421327 66641292 68343806 0.327721375576283 8 1
95 17 95 494 58 0.541934619292742 0.268200552997098 38 0.541934619292742 0.268200552997098 68347041 72131649 0.327721375576283 4 1
96 17 96 161 23 1.24104248952165 1.33838025216399 51 1.24104248952165 1.33838025216399 72647576 73507619 0.327721375576283 10 1
97 17 97 550 70 0.657512681404624 0.571587592059967 41 0.654355093203093 0.539361294380203 73644160 75393543 0.327721375576283 5 1
98 17 98 223 28 1.14071298919031 1.24127104934854 50 1.14956099825109 1.37523401336064 75472000 75631683 0.327721375576283 9 1
99 17 99 197 26 1.42707087008239 1.91043878413893 52 1.42707087008239 1.91043878413893 75640348 75851786 0.327721375576283 12 1
100 17 100 164 19 0.645411045431829 0.445477981848009 41 0.654355093203093 0.539361294380203 75855203 76041054 0.327721375576283 5 1
101 17 101 398 68 0.263649465816892 0.0644628897060064 32 0.256249178481206 0.0761405236796269 76043751 77143770 0.317763160521969 3 1
102 17 102 104 12 0.745604550211731 0.553207213569641 44 0.766932720838091 NA 77190710 78117299 0.327721375576283 6 NA
103 17 103 323 58 0.24888307259224 0.0597005047484547 32 0.256249178481206 0.0761405236796269 78117658 78835456 0.317763160521969 3 1
104 17 104 370 62 0.591073379030902 0.394102499826641 39 0.594974755214958 0.394102499826641 78836175 80327999 0.327721375576283 5 1
105 17 105 273 41 0.117426915096989 0.0295426546598028 28 0.11348290464122 0.0275972303379492 80328357 81123203 1 2 1
106 17 106 121 25 0.415194109205864 0.277221126514076 34 0.426659426492253 0.263104089062555 81123359 81376133 0.327721375576283 4 1
107 17 107 833 120 0.0964010992692905 0.0074241427627793 27 0.11348290464122 0.00812075895090372 81379785 83094666 1 2 1
108 18 108 3704 411 -0.00413434909053476 -0.0023716856583908 24 -0.0181585869172056 -0.000148105152755852 47409 47231231 1 2 1
109 18 109 139 28 -0.367450841877744 0.00461864329776326 9 -0.341668389194708 0.00346965622444364 47244904 47848774 0.222442760312971 0 0
110 18 110 2183 241 0.0184181224325998 0.00624781062878429 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 47851262 80247240 1 2 1
111 19 111 4059 656 -0.0286687951954578 -0.00200535401095503 24 -0.0181585869172056 -0.000148105152755852 110783 8858583 1 2 1
112 19 112 438 84 -0.228725242611427 0.00199089459004889 16 -0.191688519388406 0.00216676299976379 8858746 9759988 0.165581044313547 0 0
113 19 113 4652 566 -0.0223591048419863 0.00201261705513808 24 -0.0181585869172056 -0.000148105152755852 9760047 19680381 1 2 1
114 19 114 269 39 -0.320314292307506 0.0143697774326464 8 -0.341668389194708 0.00550962615328224 19711904 24126830 0.256839198553774 0 0
115 19 115 1453 143 0.0051050421312388 0.00159095761144394 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 29207716 36237345 1 2 1
116 19 116 319 42 -0.341668389194708 -0.000644306824645469 8 -0.341668389194708 0.00550962615328224 36340118 37889479 0.256839198553774 0 0
117 19 117 6430 899 0.0132631007308931 0.00119555524189441 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 37889811 52065889 1 2 1
118 19 118 391 58 -0.202114721073596 0.000867155142603455 18 -0.191688519388406 0.000867155142603455 52066217 53569341 0.184213108245123 0 0
119 19 119 1895 340 -0.00338851289644959 -0.0019670110168866 24 -0.0181585869172056 -0.000148105152755852 53571619 57974078 1 2 1
120 19 120 10 2 -0.803631201395573 -0.03124982212321 3 -0.803631201395573 NA 57974460 57980367 0.327721375576283 0 0
121 19 121 269 32 0.0953291703064038 0.00178644704186909 27 0.11348290464122 0.00812075895090372 57988115 58571468 1 2 1
122 20 122 8985 1145 0.0605180420244611 0.000882663479534793 25 0.0344795067199907 0.00218549362546302 87623 64273701 1 2 1
123 21 123 3832 516 0.0506366194053386 0.00423484878151255 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 5126040 46664501 1 2 1
124 22 124 1448 193 -0.218825357338716 0.148145883124611 15 -0.191688519388406 0.161825240800357 15528334 23261404 0.327721375576283 1 0
125 22 125 183 32 -0.514359340818271 0.155902484463714 7 -0.514359340818271 0.155902484463714 23261827 23318141 0.321513491084444 0 0
126 22 126 6144 795 -0.183583260390696 0.169110104652419 15 -0.191688519388406 0.161825240800357 23573183 50782258 0.327721375576283 1 0
127 23 127 430 37 0.0550141116061905 0.00881809622391784 26 0.0344795067199907 0.00488661583051373 284229 8170130 1 2 1
128 23 128 7 4 -0.739839255859095 0.386839180279412 4 -0.739839255859095 NA 8170408 8466523 0.327721375576283 0 0
129 23 129 2728 203 -0.0234612739075693 0.0127084623325567 23 -0.0181585869172056 0.00558675432027818 8533035 42778199 1 2 1
130 23 130 2229 146 -0.181018806087413 0.081978454017996 17 -0.191688519388406 0.0787088453181781 43656427 57448710 0.321590680369429 1 0
131 23 131 7487 602 -0.0760146144485057 0.00596356356003025 21 -0.0688206628949619 0.00627253086448103 57488779 155545286 1 2 1
132 rows