SampleID Chromosome Start_position End_position total_cn A_cn B_cn ploidy 1029_0W2 1 14599 69897 0 0 0 3.0026186920235 1029_0W2 1 70211 16548855 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 1 16549146 16945941 0 0 0 3.0026186920235 1029_0W2 1 16946300 109858768 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 1 109859093 121387475 1 1 0 3.0026186920235 1029_0W2 1 121387816 145400364 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 1 145842400 192181478 4 3 1 3.0026186920235 1029_0W2 1 192184252 248936689 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 2 41404 25883686 2 1 1 3.0026186920235 1029_0W2 2 25928956 86480411 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 2 86481749 111872835 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 2 111873392 196639821 4 3 1 3.0026186920235 1029_0W2 2 196646360 242122253 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 3 51435 59101739 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 3 59332015 85802096 4 2 2 3.0026186920235 1029_0W2 3 85802384 189584537 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 3 189597263 198169927 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 4 15706 190179679 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 5 23529 50399214 4 2 2 3.0026186920235 1029_0W2 5 50399747 90856117 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 5 90863824 105854543 5 3 2 3.0026186920235 1029_0W2 5 106277457 141441777 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 5 141476042 181283522 3 3 0 3.0026186920235 1029_0W2 6 350829 48214782 3 3 0 3.0026186920235 1029_0W2 6 48271081 64436218 4 3 1 3.0026186920235 1029_0W2 6 64436352 170640492 2 1 1 3.0026186920235 1029_0W2 7 19678 8141649 4 3 1 3.0026186920235 1029_0W2 7 8142129 11723206 5 3 2 3.0026186920235 1029_0W2 7 11820301 34143190 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 7 34143388 158941821 4 2 2 3.0026186920235 1029_0W2 8 153116 31032689 2 1 1 3.0026186920235 1029_0W2 8 31033642 32855832 0 0 0 3.0026186920235 1029_0W2 8 33018513 43416954 2 1 1 3.0026186920235 1029_0W2 8 45967768 50148453 14 8 6 3.0026186920235 1029_0W2 8 50153155 132031953 7 7 0 3.0026186920235 1029_0W2 8 132032146 144886756 6 6 0 3.0026186920235 1029_0W2 9 14690 68357839 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 9 68378293 138105761 3 3 0 3.0026186920235 1029_0W2 9 138112204 138233954 1 1 0 3.0026186920235 1029_0W2 10 47140 133626908 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 11 86614 3422605 0 0 0 3.0026186920235 1029_0W2 11 3493486 55170778 2 1 1 3.0026186920235 1029_0W2 11 55262236 55297491 0 0 0 3.0026186920235 1029_0W2 11 55297716 134720697 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 12 157429 19457534 4 4 0 3.0026186920235 1029_0W2 12 19462627 32337341 5 5 0 3.0026186920235 1029_0W2 12 32337830 39330201 7 5 2 3.0026186920235 1029_0W2 12 39641240 126638551 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 12 126639558 133247788 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 13 18173200 114326419 2 1 1 3.0026186920235 1029_0W2 14 16047801 35127717 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 14 35176196 36517872 9 7 2 3.0026186920235 1029_0W2 14 36518257 104138809 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 14 104139189 106875327 1 1 0 3.0026186920235 1029_0W2 15 17071483 22459283 1 1 0 3.0026186920235 1029_0W2 15 22460797 81343228 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 15 81368211 87854753 3 3 0 3.0026186920235 1029_0W2 15 87855095 88262301 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 15 88359094 101779064 3 3 0 3.0026186920235 1029_0W2 15 101779539 101976531 1 1 0 3.0026186920235 1029_0W2 16 14637 166667 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 16 167015 3993700 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 16 4007408 61655466 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 16 61655775 90106888 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 17 118327 21299058 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 17 21300622 76227041 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 17 76240232 76902761 5 4 1 3.0026186920235 1029_0W2 17 76903291 83094675 5 4 1 3.0026186920235 1029_0W2 18 624824 62895213 2 1 1 3.0026186920235 1029_0W2 18 62895696 80247252 1 1 0 3.0026186920235 1029_0W2 19 106243 52064556 3 2 1 3.0026186920235 1029_0W2 19 52065160 53773283 1 1 0 3.0026186920235 1029_0W2 19 53775607 58598968 5 4 1 3.0026186920235 1029_0W2 20 80747 64327953 3 3 0 3.0026186920235 1029_0W2 21 5031796 13052061 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 21 13161357 46664533 3 3 0 3.0026186920235 1029_0W2 22 10679097 25179369 2 2 0 3.0026186920235 1029_0W2 22 25179737 50798749 2 2 0 3.0026186920235