| fastp version: | 1.3.3 (https://github.com/OpenGene/fastp) |
| sequencing: | paired end (143 cycles + 143 cycles) |
| mean length before filtering: | 139bp, 139bp |
| mean length after filtering: | 138bp, 138bp |
| duplication rate: | 6.622800% |
| Insert size peak: | 166 |
| total reads: | 500.000000 K |
| total bases: | 69.659248 M |
| Q20 bases: | 68.859345 M (98.851692%) |
| Q30 bases: | 67.282701 M (96.588325%) |
| Q40 bases: | 67.282701 M (96.588325%) |
| GC content: | 48.688995% |
| total reads: | 489.548000 K |
| total bases: | 67.607793 M |
| Q20 bases: | 67.188417 M (99.379693%) |
| Q30 bases: | 65.801541 M (97.328338%) |
| Q40 bases: | 65.801541 M (97.328338%) |
| GC content: | 48.843004% |
| reads passed filters: | 489.548000 K (97.909600%) |
| reads with low quality: | 9.058000 K (1.811600%) |
| reads with too many N: | 150 (0.030000%) |
| reads too short: | 1.244000 K (0.248800%) |
| reads with adapter dimer: | 0 (0.000000%) |
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Adapter or bad ligation of read1
The input has little adapter percentage (~0.751286%), probably it's trimmed before.
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Adapter or bad ligation of read2
The input has little adapter percentage (~0.755213%), probably it's trimmed before.
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Value of each position will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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Darker background means larger counts. The count will be shown on mouse over.
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