#SAMPLE=Sig_18_tissue context rev_comp f1r2_a f1r2_c f1r2_g f1r2_t f2r1_a f2r1_c f2r1_g f2r1_t hom_ref germline_het somatic_het hom_var num_examples num_alt_examples AAA TTT 0 7.1408e-06 3.39095e-06 3.72926e-06 0 3.9088e-05 5.09953e-05 2.57278e-06 0.998625 0.000140698 0.000848855 0.000278306 39882 4496 AAC GTT 0 5.91631e-06 0.000283083 5.3618e-06 0 6.82831e-06 6.6923e-05 5.36006e-06 0.998159 0.00026626 0.000928492 0.000272596 18708 2465 AAG CTT 0 3.81078e-06 3.62573e-05 3.6583e-06 0 5.05109e-05 4.78746e-05 3.67518e-06 0.998543 0.000166662 0.000740282 0.000404563 27436 4632 AAT ATT 0 4.99674e-06 5.06213e-05 4.44163e-06 0 0.000126933 4.63344e-06 4.85677e-06 0.998839 0.000223809 0.000609793 0.00013084 23694 2791 ACA TGT 0.00084909 0 3.78459e-06 6.76301e-05 0.00171826 0 3.80293e-06 4.99942e-05 0.995369 2.10937e-05 0.00161424 0.000303348 26701 9106 ACC GGT 0.000173174 0 4.99857e-06 6.89846e-05 0.00109688 0 5.01195e-06 4.96355e-05 0.99702 0.000692221 0.000635347 0.000253567 20112 6529 ACG CGT 0.00125076 0 1.17386e-05 0.000711391 0.00270398 0 1.17386e-05 9.69937e-05 0.98693 0.00207152 0.00423719 0.00197493 8662 4138 ACT AGT 0.000750722 0 5.03587e-06 0.000119369 0.00103519 0 5.50485e-05 6.29245e-06 0.996424 0.000308792 0.000841498 0.000453697 20057 6275 AGA TCT 7.99517e-05 6.22545e-05 0 0.000158774 0.00045276 3.71498e-06 0 0.000346299 0.997426 0.000112731 0.00098008 0.00037715 29429 7395 AGC GCT 2.96017e-05 3.87329e-06 0 0.00217574 0.000151483 3.8075e-06 0 0.00118363 0.994698 2.11871e-05 0.00136397 0.000368914 26451 9844 AGG CCT 4.53357e-06 2.57079e-05 0 0.000170746 9.46504e-05 4.35896e-05 0 0.000287379 0.998056 0.000309855 0.00064237 0.000364987 30411 9063 AGT ACT 6.29245e-06 5.50485e-05 0 0.00103519 0.000119369 5.03587e-06 0 0.000750722 0.996424 0.000308792 0.000841498 0.000453697 20057 6275 ATA TAT 5.78084e-06 6.88355e-06 0.000202182 0 6.45625e-06 0.000332353 1.41313e-05 0 0.99703 0.000361564 0.00186513 0.000175112 17702 2442 ATC GAT 5.97243e-06 0.000170377 0.000102918 0 6.74007e-06 0.000533109 6.56935e-06 0 0.997299 2.7927e-05 0.00118919 0.00065835 16846 2478 ATG CAT 4.40745e-06 8.78512e-05 4.38521e-05 0 4.54861e-06 0.000286134 5.26942e-05 0 0.996084 0.000232126 0.00214931 0.0010554 22834 3313 ATT AAT 4.85677e-06 4.63344e-06 0.000126933 0 4.44163e-06 5.06213e-05 4.99674e-06 0 0.998839 0.000223809 0.000609793 0.00013084 23694 2791 CAA TTG 0 1.20959e-05 5.29885e-05 4.44807e-06 0 1.42722e-05 5.13295e-06 4.45592e-06 0.998598 0.000254992 0.00064968 0.000403763 22537 3254 CAC GTG 0 6.04548e-05 0.000186038 3.91696e-06 0 0.000175963 6.62158e-06 3.98565e-06 0.996029 0.000563079 0.00187774 0.00109307 25704 3850 CAG CTG 0 2.82396e-06 3.35121e-05 2.61618e-06 0 3.15593e-06 3.21528e-05 2.63312e-06 0.997462 0.000598652 0.000976591 0.000886266 38475 7623 CAT ATG 0 5.26942e-05 0.000286134 4.54861e-06 0 4.38521e-05 8.78512e-05 4.40745e-06 0.996084 0.000232126 0.00214931 0.0010554 22834 3313 CCA TGG 0.00042964 0 3.30365e-06 1.10593e-05 0.000695936 0 3.29467e-06 3.5485e-06 0.997846 2.77386e-05 0.000813395 0.000165999 30722 9753 CCC GGG 3.25241e-05 0 3.74012e-06 8.2401e-05 0.000260071 0 3.40844e-06 3.68057e-06 0.998096 0.000194542 0.000853105 0.000470054 29833 7526 CCG CGG 0.000756546 0 5.68236e-05 0.000657934 0.00130023 0 1.18001e-05 1.36244e-05 0.989276 0.0027303 0.00324812 0.0019487 13395 5562 CCT AGG 0.000287379 0 4.35896e-05 9.46504e-05 0.000170746 0 2.57079e-05 4.53357e-06 0.998056 0.000309855 0.00064237 0.000364987 30411 9063 CGA TCG 0.000313503 1.40459e-05 0 0.00117387 0.00245287 1.39667e-05 0 0.000929435 0.989798 0.0028819 0.0012982 0.00112422 7204 3013 CGC GCG 0.0011488 2.21048e-05 0 0.00450899 8.44498e-05 8.94387e-06 0 0.00222495 0.984071 0.00103118 0.00490668 0.00199261 11592 5571 CGG CCG 1.36244e-05 1.18001e-05 0 0.00130023 0.000657934 5.68236e-05 0 0.000756546 0.989276 0.0027303 0.00324812 0.0019487 13395 5562 CGT ACG 9.69937e-05 1.17386e-05 0 0.00270398 0.000711391 1.17386e-05 0 0.00125076 0.98693 0.00207152 0.00423719 0.00197493 8662 4138 CTA TAG 8.21038e-06 8.88715e-06 2.96231e-05 0 7.95346e-06 0.00031259 8.46541e-06 0 0.997068 0.000327536 0.00198265 0.000246208 12590 2150 CTC GAG 2.75821e-05 4.27018e-05 4.88152e-05 0 3.6168e-06 0.000244072 3.78506e-06 0 0.997778 1.85713e-05 0.00147663 0.000356272 27853 5236 CTG CAG 2.63312e-06 3.21528e-05 3.15593e-06 0 2.61618e-06 3.35121e-05 2.82396e-06 0 0.997462 0.000598652 0.000976591 0.000886266 38475 7623 CTT AAG 3.67518e-06 4.78746e-05 5.05109e-05 0 3.6583e-06 3.62573e-05 3.81078e-06 0 0.998543 0.000166662 0.000740282 0.000404563 27436 4632 GAA TTC 0 3.93717e-06 2.43821e-05 3.71197e-06 0 5.10073e-06 5.0829e-06 3.74999e-06 0.999278 6.34203e-05 0.000497373 0.000114908 26977 3516 GAC GTC 0 6.87451e-06 0.000110024 5.69905e-06 0 9.58974e-05 9.51943e-06 5.73163e-06 0.998093 7.30977e-05 0.00125344 0.000347123 17572 2616 GAG CTC 0 3.78506e-06 0.000244072 3.6168e-06 0 4.88152e-05 4.27018e-05 2.75821e-05 0.997778 1.85713e-05 0.00147663 0.000356272 27853 5236 GAT ATC 0 6.56935e-06 0.000533109 6.74007e-06 0 0.000102918 0.000170377 5.97243e-06 0.997299 2.7927e-05 0.00118919 0.00065835 16846 2478 GCA TGC 0.00115176 0 3.90699e-06 9.32827e-05 0.00203596 0 3.85575e-06 4.72947e-05 0.995549 8.18501e-05 0.000725293 0.000307494 26341 10357 GCC GGC 0.0007873 0 1.70921e-05 1.25965e-05 0.00175354 0 4.07931e-05 3.2765e-05 0.995749 5.23824e-05 0.0011521 0.000402816 27555 10150 GCG CGC 0.00222495 0 8.94387e-06 8.44498e-05 0.00450899 0 2.21048e-05 0.0011488 0.984071 0.00103118 0.00490668 0.00199261 11592 5571 GCT AGC 0.00118363 0 3.8075e-06 0.000151483 0.00217574 0 3.87329e-06 2.96017e-05 0.994698 2.11871e-05 0.00136397 0.000368914 26451 9844 GGA TCC 4.05443e-06 3.764e-06 0 0.000163209 0.000140868 4.15977e-05 0 3.47111e-05 0.998309 0.00030065 0.000737781 0.000264472 26848 6309 GGC GCC 3.2765e-05 4.07931e-05 0 0.00175354 1.25965e-05 1.70921e-05 0 0.0007873 0.995749 5.23824e-05 0.0011521 0.000402816 27555 10150 GGG CCC 3.68057e-06 3.40844e-06 0 0.000260071 8.2401e-05 3.74012e-06 0 3.25241e-05 0.998096 0.000194542 0.000853105 0.000470054 29833 7526 GGT ACC 4.96355e-05 5.01195e-06 0 0.00109688 6.89846e-05 4.99857e-06 0 0.000173174 0.99702 0.000692221 0.000635347 0.000253567 20112 6529 GTA TAC 7.47944e-06 8.10806e-06 0.000161005 0 7.40961e-06 1.3929e-05 3.04426e-05 0 0.997367 1.45495e-05 0.0016444 0.000745442 13548 2172 GTC GAC 5.73163e-06 9.51943e-06 9.58974e-05 0 5.69905e-06 0.000110024 6.87451e-06 0 0.998093 7.30977e-05 0.00125344 0.000347123 17572 2616 GTG CAC 3.98565e-06 6.62158e-06 0.000175963 0 3.91696e-06 0.000186038 6.04548e-05 0 0.996029 0.000563079 0.00187774 0.00109307 25704 3850 GTT AAC 5.36006e-06 6.6923e-05 6.82831e-06 0 5.3618e-06 0.000283083 5.91631e-06 0 0.998159 0.00026626 0.000928492 0.000272596 18708 2465 TAA TTA 0 5.71448e-05 6.8017e-06 5.15632e-05 0 1.82155e-05 5.26641e-06 5.30262e-06 0.997704 0.00012809 0.00152722 0.000495949 20364 2593 TAC GTA 0 3.04426e-05 1.3929e-05 7.40961e-06 0 0.000161005 8.10806e-06 7.47944e-06 0.997367 1.45495e-05 0.0016444 0.000745442 13548 2172 TAG CTA 0 8.46541e-06 0.00031259 7.95346e-06 0 2.96231e-05 8.88715e-06 8.21038e-06 0.997068 0.000327536 0.00198265 0.000246208 12590 2150 TAT ATA 0 1.41313e-05 0.000332353 6.45625e-06 0 0.000202182 6.88355e-06 5.78084e-06 0.99703 0.000361564 0.00186513 0.000175112 17702 2442 TCA TGA 0.000327818 0 3.91822e-06 7.13462e-06 0.000890296 0 3.55611e-05 4.75159e-06 0.997723 0.000130073 0.000564527 0.000312632 25759 7364 TCC GGA 3.47111e-05 0 4.15977e-05 0.000140868 0.000163209 0 3.764e-06 4.05443e-06 0.998309 0.00030065 0.000737781 0.000264472 26848 6309 TCG CGA 0.000929435 0 1.39667e-05 0.00245287 0.00117387 0 1.40459e-05 0.000313503 0.989798 0.0028819 0.0012982 0.00112422 7204 3013 TCT AGA 0.000346299 0 3.71498e-06 0.00045276 0.000158774 0 6.22545e-05 7.99517e-05 0.997426 0.000112731 0.00098008 0.00037715 29429 7395 TGA TCA 4.75159e-06 3.55611e-05 0 0.000890296 7.13462e-06 3.91822e-06 0 0.000327818 0.997723 0.000130073 0.000564527 0.000312632 25759 7364 TGC GCA 4.72947e-05 3.85575e-06 0 0.00203596 9.32827e-05 3.90699e-06 0 0.00115176 0.995549 8.18501e-05 0.000725293 0.000307494 26341 10357 TGG CCA 3.5485e-06 3.29467e-06 0 0.000695936 1.10593e-05 3.30365e-06 0 0.00042964 0.997846 2.77386e-05 0.000813395 0.000165999 30722 9753 TGT ACA 4.99942e-05 3.80293e-06 0 0.00171826 6.76301e-05 3.78459e-06 0 0.00084909 0.995369 2.10937e-05 0.00161424 0.000303348 26701 9106 TTA TAA 5.30262e-06 5.26641e-06 1.82155e-05 0 5.15632e-05 6.8017e-06 5.71448e-05 0 0.997704 0.00012809 0.00152722 0.000495949 20364 2593 TTC GAA 3.74999e-06 5.0829e-06 5.10073e-06 0 3.71197e-06 2.43821e-05 3.93717e-06 0 0.999278 6.34203e-05 0.000497373 0.000114908 26977 3516 TTG CAA 4.45592e-06 5.13295e-06 1.42722e-05 0 4.44807e-06 5.29885e-05 1.20959e-05 0 0.998598 0.000254992 0.00064968 0.000403763 22537 3254 TTT AAA 2.57278e-06 5.09953e-05 3.9088e-05 0 3.72926e-06 3.39095e-06 7.1408e-06 0 0.998625 0.000140698 0.000848855 0.000278306 39882 4496