File Info

Filename
multiqc_data/variant_classes_plot.txt
Full Path
s3://natera-rnd-pltf-dev-nextflow-scratch-01/work/88/027954c3c6b63e1ea70137a27bbfe7/multiqc_data/variant_classes_plot.txt
Size
1.0 KB
Task
NFCORE_SAREK:SAREK:MULTIQC
Attempt

Content

View in new tab 
Sample	insertion	deletion	SNV	copy_number_variation	indel	chromosome_breakpoint
HCC1395_BL.deconflicted_germline_custom.ann_snpEff_VEP.ann	9.0	11.0	334.0	nan	nan	nan
HCC1395_BL_custom.ann_snpEff_VEP.ann	nan	2.0	nan	1.0	nan	nan
HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.manta.diploid_sv_custom.ann_snpEff_VEP.ann	nan	nan	nan	nan	1.0	2.0
HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.manta.somatic_sv_custom.ann_snpEff_VEP.ann	nan	nan	nan	nan	nan	2.0
HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.strelka.somatic_indels_custom.ann_snpEff_VEP.ann	19.0	23.0	nan	nan	nan	nan
HCC1395_tumor_vs_HCC1395_BL.strelka.somatic_snvs_custom.ann_snpEff_VEP.ann	nan	nan	300.0	nan	nan	nan
Sig_18_Blood.deconflicted_germline_custom.ann_snpEff_VEP.ann	12.0	14.0	369.0	nan	nan	nan
Sig_18_Blood_custom.ann_snpEff_VEP.ann	nan	2.0	nan	1.0	nan	nan
custom_Sig_18_tumor_normal.manta.diploid_sv_custom.ann_snpEff_VEP.ann	1.0	2.0	nan	nan	1.0	2.0
custom_Sig_18_tumor_normal.strelka.somatic_indels_custom.ann_snpEff_VEP.ann	36.0	52.0	nan	nan	nan	nan
custom_Sig_18_tumor_normal.strelka.somatic_snvs_custom.ann_snpEff_VEP.ann	nan	nan	237.0	nan	nan	nan