File Info
- Filename
- 1173_N5V.cnv.hmnz.tsv
- Full Path
- s3://natera-platform-sandbox/platform-users/rsrivas/pipeline_runs/somatic_sv_dev/01_altera_exact_survey_feb26/Harmonize_dspe1173__b003992--20260226-165137/1173_N5V/variants/cnv/1173_N5V.cnv.hmnz.tsv
- Size
- 2.0 KB
- Workflow Run
- Harmonize_dspe1173
- Published
- Feb 26, 2026 9:00 AM
Content
View in new tab| sample | gene | amp_del | log2_ratio | chrom | gene_start | gene_end | consequence |
| 1173_N5V | NOXA1 | DEL | -1.72256 | chr9 | 137423349 | 137434406 | DEL |
| 1173_N5V | ENTPD8 | DEL | -1.59831 | chr9 | 137434363 | 137441449 | DEL |
| 1173_N5V | NSMF | DEL | -1.40406 | chr9 | 137447572 | 137459334 | DEL |
| 1173_N5V | FAM21B | DEL | -3.0817 | chr10 | 50078125 | 50132945 | DEL |
| 1173_N5V | ASAH2 | DEL | -1.63071 | chr10 | 50182777 | 50248610 | DEL |
| 1173_N5V | SGMS1 | DEL | -1.4067 | chr10 | 50305599 | 50623983 | DEL |
| 1173_N5V | KDM4E | DEL | -1.45774 | chr11 | 95025257 | 95027596 | DEL |
| 1173_N5V | ENDOD1 | DEL | -1.4057 | chr11 | 95089809 | 95132645 | DEL |
| 1173_N5V | SESN3 | DEL | -1.60785 | chr11 | 95165539 | 95231197 | DEL |
| 1173_N5V | TRPC6 | DEL | -1.58345 | chr11 | 101451563 | 101583928 | DEL |
| 1173_N5V | METTL25 | DEL | -1.43522 | chr12 | 82358496 | 82479236 | DEL |
| 1173_N5V | MEOX1 | DEL | -1.47769 | chr17 | 43640387 | 43661954 | DEL |
| 1173_N5V | SOST | DEL | -1.48598 | chr17 | 43753730 | 43758788 | DEL |
| 1173_N5V | DUSP3 | DEL | -1.41965 | chr17 | 43766120 | 43778988 | DEL |
| 1173_N5V | C17orf105 | DEL | -1.5788 | chr17 | 43780434 | 43787612 | DEL |
| 1173_N5V | MPP3 | DEL | -1.48582 | chr17 | 43801442 | 43833170 | DEL |
| 1173_N5V | MN1 | DEL | -1.41645 | chr22 | 27748276 | 27801498 | DEL |
| 1173_N5V | PITPNB | DEL | -1.55285 | chr22 | 27851668 | 27919268 | DEL |
| 1173_N5V | MGAT3 | DEL | -1.54721 | chr22 | 39457343 | 39492194 | DEL |
| 1173_N5V | MIEF1 | DEL | -1.73296 | chr22 | 39502352 | 39518132 | DEL |
| 1173_N5V | ATF4 | DEL | -1.55271 | chr22 | 39520563 | 39522683 | DEL |
| 1173_N5V | RPS19BP1 | DEL | -1.80242 | chr22 | 39529092 | 39532855 | DEL |
| 1173_N5V | CACNA1I | DEL | -1.51094 | chr22 | 39570752 | 39689737 | DEL |
| 1173_N5V | ENTHD1 | DEL | -1.61421 | chr22 | 39743043 | 39893790 | DEL |
| 1173_N5V | GRAP2 | DEL | -1.5714 | chr22 | 39901081 | 39973721 | DEL |
| 1173_N5V | FAM83F | DEL | -1.52139 | chr22 | 39994948 | 40043529 | DEL |
| 1173_N5V | TNRC6B | DEL | -1.49435 | chr22 | 40177924 | 40335807 | DEL |
| 1173_N5V | ADSL | DEL | -1.66259 | chr22 | 40346502 | 40367004 | DEL |
| 1173_N5V | SGSM3 | DEL | -1.50729 | chr22 | 40370610 | 40410289 | DEL |
| 1173_N5V | MKL1 | DEL | -1.5304 | chr22 | 40410280 | 40636685 | DEL |
| 1173_N5V | MCHR1 | DEL | -1.55805 | chr22 | 40678749 | 40682814 | DEL |
| 1173_N5V | SLC25A17 | DEL | -1.56023 | chr22 | 40769629 | 40819382 | DEL |
| 1173_N5V | ST13 | DEL | -1.58176 | chr22 | 40824534 | 40857022 | DEL |
| 1173_N5V | XPNPEP3 | DEL | -1.55541 | chr22 | 40857097 | 40932815 | DEL |
| 1173_N5V | DNAJB7 | DEL | -1.67423 | chr22 | 40859548 | 40862126 | DEL |
36 rows