Process Directives

Container
292967571998.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/quay/biocontainers/bcftools:1.20--h8b25389_0
CPU / Memory
1 / 1.0 GB

Tasks

429 succeeded

CPU Usage(cores)

Peak Memory(MB)

rchar(MB)

wchar(MB)

read_bytes(B)

write_bytes(MB)

Total Duration(s)

Queue(s)

Execution(s)

Stage/Unstage(s)

Clear
succeeded 1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;haplotypecaller 4s 2s - - 10.3 MB 1483% 3.4 MB 1.8 MB 0 bytes 1.8 MB 1
succeeded 1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;manta 3s 1s - - 10.5 MB 3100% 240.1 KB 39.1 KB 0 bytes 48.0 KB 1
succeeded 1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;sentieon_haplotyper 4s 2s 1s 1s 19.7 MB 5611% 3.4 MB 1.8 MB 0 bytes 1.8 MB 1
succeeded 1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;strelka 4s 2s - - 9.5 MB 1298% 2.1 MB 1.1 MB 0 bytes 1.2 MB 1
succeeded 1029_4PQ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;manta 4s 3s 1s 0s 3.2 MB 2330% 225.5 KB 29.6 KB 0 bytes 40.0 KB 1
succeeded 1029_4PQ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;manta 4s 3s 1s 0s 3.1 MB 2589% 244.7 KB 41.8 KB 0 bytes 52.0 KB 1
succeeded 1029_4PQ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;mutect2 5s 2s 1s 2s 17.8 MB 4859% 8.2 MB 4.3 MB 0 bytes 4.3 MB 1
succeeded 1029_4PQ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;strelka 4s 2s - - 3.2 MB 7651% 516.6 KB 204.8 KB 0 bytes 212.0 KB 1
succeeded 1029_4PQ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;strelka 4s 2s - - 18.4 MB 7362% 1.2 MB 629.8 KB 0 bytes 636.0 KB 1
succeeded 1029_4PQ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;tnseq 5s 2s 1s 2s 12.6 MB 989% 20.5 MB 10.6 MB 0 bytes 10.6 MB 1
succeeded 1029_4PQ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_4PQ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;tnseq 5s 2s 1s 2s 18.2 MB 2362% 20.8 MB 10.8 MB 0 bytes 10.8 MB 1
succeeded 1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;haplotypecaller 6s 4s - - 15.6 MB 1689% 3.4 MB 1.8 MB 0 bytes 1.9 MB 1
succeeded 1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;manta 4s 3s - - 3.3 MB 3296% 236.4 KB 36.3 KB 0 bytes 48.0 KB 1
succeeded 1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;sentieon_haplotyper 4s 2s 1s 1s 17.7 MB 5880% 3.5 MB 1.9 MB 0 bytes 1.9 MB 1
succeeded 1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;strelka 4s 2s 1s 1s 15.1 MB 1421% 2.1 MB 1.2 MB 0 bytes 1.2 MB 1
succeeded 1029_BFGZ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;manta 4s 2s - - 14.8 MB 4590% 237.1 KB 35.1 KB 0 bytes 48.0 KB 1
succeeded 1029_BFGZ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;manta 4s 2s - - 16.5 MB 8979% 250.3 KB 40.9 KB 0 bytes 52.0 KB 1
succeeded 1029_BFGZ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;mutect2 8s 5s 1s 2s 12.8 MB 322% 8.9 MB 4.6 MB 0 bytes 4.6 MB 1
succeeded 1029_BFGZ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;strelka 4s 2s - - 3.3 MB 2217% 505.9 KB 200.3 KB 0 bytes 212.0 KB 1
succeeded 1029_BFGZ-T1-TDNA-1_A23L3H3LT4_1_vs_1029_BFGZ-N1-BDNA-1_B23L5TMLT4_1;strelka 4s 2s 1s 1s 15.3 MB 2739% 2.1 MB 1.1 MB 0 bytes 1.1 MB 1
429 items found |