## htsjdk.samtools.metrics.StringHeader
# CollectInsertSizeMetrics --Histogram_FILE aih-tih-sc-f7ac14-R1_A23YTGFLT4_1_collectinsertsize.pdf --INPUT aih-tih-sc-f7ac14-R1_A23YTGFLT4_1.Aligned.sortedByCoord.out.bam --OUTPUT aih-tih-sc-f7ac14-R1_A23YTGFLT4_1_collectinsertsize.txt --DEVIATIONS 10.0 --MINIMUM_PCT 0.05 --METRIC_ACCUMULATION_LEVEL ALL_READS --INCLUDE_DUPLICATES false --ASSUME_SORTED true --STOP_AFTER 0 --VERBOSITY INFO --QUIET false --VALIDATION_STRINGENCY STRICT --COMPRESSION_LEVEL 5 --MAX_RECORDS_IN_RAM 500000 --CREATE_INDEX false --CREATE_MD5_FILE false --help false --version false --showHidden false --USE_JDK_DEFLATER false --USE_JDK_INFLATER false
## htsjdk.samtools.metrics.StringHeader
# Started on: Wed Jun 03 22:36:33 GMT 2026
## METRICS CLASS picard.analysis.InsertSizeMetrics
MEDIAN_INSERT_SIZE MODE_INSERT_SIZE MEDIAN_ABSOLUTE_DEVIATION MIN_INSERT_SIZE MAX_INSERT_SIZE MEAN_INSERT_SIZE STANDARD_DEVIATION READ_PAIRS PAIR_ORIENTATION WIDTH_OF_10_PERCENT WIDTH_OF_20_PERCENT WIDTH_OF_30_PERCENT WIDTH_OF_40_PERCENT WIDTH_OF_50_PERCENT WIDTH_OF_60_PERCENT WIDTH_OF_70_PERCENT WIDTH_OF_80_PERCENT WIDTH_OF_90_PERCENT WIDTH_OF_95_PERCENT WIDTH_OF_99_PERCENT SAMPLE LIBRARY READ_GROUP
128 88 53 6 632754 146.364031 111.876672 287724165 FR 23 45 65 85 107 137 321 1489 5093 11575 56311
## HISTOGRAM java.lang.Integer
insert_size All_Reads.fr_count
6 5
7 2
8 16
9 9
10 7
11 25
12 87
13 41
14 539
15 1777
16 2709
17 2949
18 2951
19 2612
20 2885
21 3712
22 4190
23 3769
24 3979
25 5022
26 7197
27 10337
28 12824
29 18114
30 23897
31 32544
32 42605
33 48984
34 60902
35 75365
36 91693
37 112611
38 136573
39 160598
40 193922
41 225669
42 258448
43 292524
44 322803
45 353171
46 389293
47 425639
48 464526
49 512290
50 558746
51 606264
52 663401
53 721422
54 766750
55 824987
56 858036
57 897977
58 951341
59 996362
60 1056164
61 1127474
62 1200998
63 1267185
64 1343417
65 1416805
66 1459093
67 1513256
68 1557183
69 1593754
70 1664323
71 1716805
72 1776998
73 1877544
74 1944167
75 2009188
76 2077504
77 2099473
78 2123704
79 2143049
80 2168409
81 2185953
82 2237295
83 2282720
84 2326088
85 2386409
86 2418557
87 2435713
88 2445184
89 2420822
90 2399030
91 2380099
92 2364222
93 2356711
94 2379190
95 2395299
96 2397269
97 2403475
98 2386646
99 2337792
100 2303222
101 2252611
102 2197039
103 2173359
104 2132696
105 2125684
106 2105431
107 2089169
108 2064668
109 2043964
110 1975498
111 1908782
112 1857616
113 1807849
114 1760513
115 1738118
116 1703556
117 1681743
118 1657533
119 1627575
120 1581560
121 1531614
122 1486890
123 1425880
124 1387920
125 1363795
126 1320366
127 1301109
128 1270004
129 1240231
130 1211289
131 1180275
132 1142251
133 1103743
134 1058825
135 1027860
136 1005398
137 980894
138 954128
139 941832
140 910848
141 891789
142 869012
143 846193
144 815364
145 786783
146 761828
147 746315
148 725967
149 710150
150 695447
151 685143
152 669367
153 651295
154 628626
155 614195
156 595028
157 580976
158 565816
159 550644
160 543375
161 535799
162 523819
163 514224
164 504854
165 489702
166 476932
167 463525
168 457944
169 450114
170 444759
171 437177
172 431887
173 420160
174 414567
175 408638
176 404390
177 395416
178 386083
179 381387
180 374233
181 371864
182 368119
183 363102
184 356246
185 351746
186 350198
187 341542
188 337337
189 330240
190 328368
191 319202
192 315200
193 313526
194 307634
195 302661
196 302549
197 301257
198 297695
199 291973
200 293157
201 284346
202 280077
203 278120
204 277962
205 279869
206 271524
207 264725
208 262648
209 261036
210 253793
211 252181
212 245354
213 240334
214 241399
215 243909
216 237871
217 235287
218 229332
219 222614
220 222622
221 221160
222 217930
223 213608
224 210639
225 208296
226 206699
227 204785
228 200594
229 200765
230 196387
231 192049
232 190936
233 190327
234 187249
235 183909
236 180845
237 176981
238 177657
239 173626
240 172052
241 170465
242 168995
243 163514
244 162804
245 162286
246 157180
247 156705
248 155491
249 150627
250 147939
251 148364
252 145364
253 143838
254 140248
255 141517
256 138541
257 137780
258 137282
259 136430
260 135278
261 131397
262 130424
263 128934
264 127116
265 125715
266 126609
267 122041
268 123016
269 120901
270 120921
271 117775
272 121713
273 114515
274 117357
275 115938
276 113914
277 111883
278 111714
279 109362
280 110177
281 109106
282 106901
283 106353
284 106028
285 105684
286 104654
287 104190
288 103386
289 102688
290 101042
291 102203
292 100992
293 99081
294 98236
295 99877
296 99306
297 98117
298 98437
299 97295
300 97147
301 96416
302 95047
303 94202
304 93516
305 94489
306 93862
307 93476
308 92721
309 92099
310 92657
311 92102
312 91757
313 91337
314 92086
315 90166
316 88918
317 88979
318 90535
319 89965
320 87973
321 86901
322 86414
323 86105
324 84991
325 86665
326 85147
327 86740
328 85728
329 87019
330 84561
331 84250
332 85620
333 82426
334 82867
335 83327
336 82815
337 84624
338 81800
339 82431
340 80582
341 79551
342 80789
343 80694
344 80939
345 80361
346 79603
347 78357
348 77787
349 78619
350 75926
351 76294
352 76627
353 77152
354 76934
355 74681
356 77106
357 74986
358 74278
359 73385
360 73774
361 72162
362 72459
363 72632
364 71084
365 71936
366 71708
367 71562
368 71394
369 69422
370 70180
371 69432
372 69776
373 69139
374 68857
375 68822
376 69962
377 69570
378 68530
379 67441
380 68515
381 67699
382 65864
383 66129
384 65705
385 65934
386 67103
387 66487
388 66348
389 67156
390 66697
391 65836
392 66590
393 65730
394 66227
395 65102
396 65107
397 65842
398 64863
399 64283
400 64098
401 63903
402 63836
403 65133
404 64279
405 64414
406 63341
407 63381
408 64008
409 64933
410 63359
411 63882
412 62631
413 61674
414 61914
415 62477
416 62047
417 64631
418 63674
419 62626
420 61588
421 61311
422 63158
423 62148
424 61485
425 60192
426 59524
427 58971
428 60324
429 60348
430 59805
431 58223
432 59034
433 59637
434 60039
435 58577
436 58630
437 60000
438 58042
439 57680
440 58762
441 58452
442 58087
443 57388
444 56854
445 57728
446 58149
447 57370
448 56766
449 55742
450 56967
451 56334
452 56303
453 55352
454 54943
455 55466
456 54677
457 55569
458 53884
459 54683
460 53742
461 54138
462 54252
463 53468
464 53157
465 54363
466 52949
467 52874
468 52390
469 52739
470 51995
471 51234
472 51188
473 52371
474 50300
475 51388
476 50308
477 48711
478 48489
479 49119
480 48705
481 49598
482 49430
483 50052
484 48152
485 48271
486 48026
487 48036
488 48234
489 47839
490 48421
491 48831
492 47745
493 48047
494 47735
495 49347
496 48757
497 46930
498 47225
499 46721
500 48434
501 48028
502 46829
503 48983
504 45695
505 46893
506 47011
507 47181
508 47253
509 46575
510 48344
511 47369
512 47228
513 47231
514 46504
515 47087
516 46637
517 46893
518 46409
519 47134
520 46423
521 47788
522 46611
523 46971
524 46616
525 45354
526 45571
527 45932
528 47881
529 46483
530 47433
531 47109
532 46596
533 46845
534 46381
535 46574
536 47373
537 47756
538 46334
539 45491
540 46830
541 46380
542 44985
543 45551
544 45762
545 45582
546 46445
547 45594
548 45015
549 44571
550 45766
551 44814
552 45731
553 46158
554 46088
555 46298
556 44386
557 43975
558 44102
559 43901
560 44606
561 44222
562 43427
563 43824
564 43651
565 44064
566 43339
567 44262
568 44054
569 43965
570 44055
571 44522
572 42157
573 42633
574 43425
575 42345
576 43777
577 44105
578 43655
579 42216
580 43117
581 42217
582 43370
583 42512
584 41536
585 43692
586 43325
587 42385
588 43912
589 41650
590 42602
591 41337
592 41094
593 41565
594 42440
595 41092
596 41517
597 40805
598 41123
599 40694
600 40429
601 41121
602 40760
603 40324
604 40606
605 38972
606 38366
607 39530
608 39501
609 40239
610 39312
611 37969
612 39030
613 39181
614 38485
615 38457
616 39260
617 38012
618 39494
619 37787
620 38207
621 39142
622 38785
623 38620
624 37991
625 37565
626 38268
627 38266
628 38210
629 38443
630 37261
631 37858
632 38451
633 38439
634 39542
635 38858
636 38969
637 38805
638 38690
639 39337
640 38654
641 39046
642 38656
643 37590
644 38343
645 38303
646 38740
647 38899
648 39095
649 39022
650 37743
651 39279
652 38768
653 38678
654 39157
655 38433
656 39509
657 38115
658 38694