Process Directives

Container
292967571998.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/quay/biocontainers/snpeff:5.1--hdfd78af_2
CPU / Memory
2 / 8.0 GB

Tasks

514 succeeded

CPU Usage(cores)

Peak Memory(GB)

rchar(MB)

wchar(MB)

read_bytes(B)

write_bytes(MB)

Total Duration(s)

Queue(s)

Execution(s)

Stage/Unstage(s)

Clear
succeeded 659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;haplotypecaller 1m 8s 3s 1m 2s 3s 2.7 GB 295% 640.5 MB 18.4 MB 0 bytes 15.6 MB 1
succeeded 659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;manta 1m 0s 4s 53s 3s 3.2 GB 196% 556.1 MB 3.6 MB 0 bytes 760.0 KB 1
succeeded 659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;sentieon_haplotyper 1m 9s 4s 1m 2s 3s 3.0 GB 223% 640.5 MB 18.9 MB 0 bytes 16.1 MB 1
succeeded 659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;strelka 1m 7s 3s 1m 2s 2s 3.0 GB 210% 639.9 MB 15.6 MB 0 bytes 12.7 MB 1
succeeded 659_91-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;manta 29s 3s 24s 2s 3.0 GB 300% 164.8 MB 3.1 MB 0 bytes 220.0 KB 1
succeeded 659_91-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;manta 1m 2s 3s 56s 3s 2.7 GB 203% 602.4 MB 3.6 MB 0 bytes 772.0 KB 1
succeeded 659_91-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;mutect2 1m 13s 3s 1m 7s 3s 2.8 GB 479% 639.9 MB 9.9 MB 0 bytes 7.0 MB 1
succeeded 659_91-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;mutect2 1m 10s 3s 1m 5s 2s 2.8 GB 377% 640.0 MB 9.9 MB 0 bytes 7.1 MB 1
succeeded 659_91-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;strelka 30s 3s 24s 3s 2.5 GB 320% 165.4 MB 8.7 MB 0 bytes 5.8 MB 1
succeeded 659_91-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;strelka 1m 4s 3s 59s 2s 3.0 GB 212% 639.1 MB 4.8 MB 0 bytes 2.0 MB 1
succeeded 659_91-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_91-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;tnseq 1m 12s 2s 1m 8s 2s 3.3 GB 351% 641.9 MB 23.4 MB 0 bytes 20.5 MB 1
succeeded 659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;haplotypecaller 1m 9s 4s 1m 3s 2s 2.9 GB 203% 640.5 MB 18.4 MB 0 bytes 15.5 MB 1
succeeded 659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;manta 1m 5s 9s 54s 2s 2.8 GB 206% 563.4 MB 3.6 MB 0 bytes 740.0 KB 1
succeeded 659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;sentieon_haplotyper 1m 8s 4s 1m 2s 2s 2.9 GB 210% 640.5 MB 18.9 MB 0 bytes 16.0 MB 1
succeeded 659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;strelka 1m 7s 3s 1m 1s 3s 3.4 GB 213% 639.8 MB 15.4 MB 0 bytes 12.5 MB 1
succeeded 659_b6L-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;manta 30s 3s 25s 2s 2.5 GB 288% 187.7 MB 3.1 MB 0 bytes 212.0 KB 1
succeeded 659_b6L-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;manta 59s 3s 53s 3s 3.0 GB 219% 563.4 MB 3.6 MB 0 bytes 772.0 KB 1
succeeded 659_b6L-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;mutect2 1m 10s 3s 1m 5s 2s 2.8 GB 379% 639.7 MB 8.4 MB 0 bytes 5.5 MB 1
succeeded 659_b6L-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;mutect2 1m 9s 2s 1m 4s 3s 2.8 GB 354% 639.7 MB 8.4 MB 0 bytes 5.5 MB 1
succeeded 659_b6L-T1-TDNA-1_A23FG3YLT4_1_vs_659_b6L-N1-BDNA-1_A23FG3YLT4_1;strelka 1m 7s 3s 1m 2s 2s 2.9 GB 207% 639.1 MB 4.9 MB 0 bytes 2.0 MB 1
514 items found |